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运行类似分析

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运行类似分析

我有一个文件夹，里面有多个子文件夹和文件。它们的名称都很相似，但唯一的区别是患者的编号

例子

Analysis/Patient_01/Brain/image_patient_01_merged.nii
Analysis/Patient_02/Brain/image_patient_02_merged.nii
Analysis/Patient_03/Brain/image_patient_03_merged.nii
.
.
.

等等。

在主文件夹（Analysis）中我想编写一个脚本来.nii循环对每个文件执行相同的操作。

例子

fslstats image_patient_01_merged.nii -M
fslstats image_patient_02_merged.nii -M
fslstats image_patient_03_merged.nii -M
.
.
.
.

换句话说，我需要对每个子目录中的nii文件做相同的分析。

答案1

使用 bash，在Analysis文件夹中，使用一个简单的 for 循环：

for f in */*/*.nii
do
    flstats "${f##*/}" -M
done

*/*/*.nii将扩展为Patient_01/Brain/image_patient_01_merged.nii等，并从中${f##*/}获取文件名。image_patient_01_merged.nii

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