将所有 fastq 文件压缩为 fastq.gz

Question

我确实有这样的 fastq 文件名称：

土壤-53_R1_001.fastq 根-29_S27_L001_R2_001.fastq
土壤-53_R2_001.fastq 根-2_S35_L001_R1_001.fastq 土壤
-54_R1_001.fastq 根-2_S35_L001_R2_001.fastq
土壤-54_R2_001.fastq

我希望它们全部以 fastq.gz 格式压缩，请建议如何使用单个命令来完成此操作。

Answer 1

gzip *.fastq

将为任何以 .fastq 结尾的文件创建一个压缩文件

gzip -r {dir}

将为在 {dir} 中找到的任何文件创建一个压缩文件。

（gzip 本身永远不会创建 1 个文件。您可以使用压缩选项tar）z