R 没有找到 anaconda 安装

R 没有找到 anaconda 安装

我尝试在 Ubuntu 系统上安装 R 包,但遇到了错误。(使用 PC 或 Mac 时不会收到此错误)

$ R
> install.packages("leiden")

...

Error: package or namespace load failed for ‘leiden’:
 .onAttach failed in attachNamespace() for 'leiden', details:
  call: py_module_import(module, convert = convert)
  error: ModuleNotFoundError: No module named 'pandas'

我很困惑,因为我可以在我的 conda 包中看到熊猫。

$ conda list | grep pandas
pandas                    1.0.1            py37h0573a6f_0

另外哪个 python 似乎给了我 anaconda 安装:

/home/usrname/anaconda3/bin/python

任何建议都值得赞赏。

答案1

我最终发现了另一个存在类似问题的问题。结果发现我需要激活 conda r-reticulate 环境。

看一下这里的类似问题: https://stackoverflow.com/questions/63220597/python-in-r-error-could-not-find-a-python-environment-for-usr-bin-python

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