#CHROM POS T1 T10 T11 T12 T13 T2 T3 T4 T5 T6 T106 T107 T108 T109 T110 T112 T114 T116 T120 T122 T125 T128 T129 T130
Aradu.A01 300806 H B B B B B B B H B B H B B B B B B B B B B B
Aradu.A01 386907 A A A A A A A A A A A A H A A A A A H A A A A
Aradu.A01 463100 B B A A A A A H B A A H H H H H B A B A H H A
Aradu.A01 471639 A A A A H A A H A A H A A A A A H A A A H A A
Aradu.A01 644024 H B B B B B B B H H B H H B B B H B H B B B H
Aradu.A01 756331 H H H H H H H H B B B H H H H H B H H H B B B
Aradu.A01 768081 A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A
Aradu.A01 783066 A A H A H H A A A A H A H A A A A A A H A A H
Aradu.A01 812865 H B H H H H H H H H H H H H H H B B H H B B H
Aradu.A01 976731 A H A H H A H H A H H A H H A A H A H A A A H
Aradu.A01 1089311 A H H H H A A A H A H B A H H H H H A A H H H
Aradu.A01 1089991 A A A H A A H A A H A A A A H A A A A A A A H
Aradu.A01 1113781 H H H H H H H A H H H H H H A H H A H A H H H
Aradu.A01 1160441 B B B B B B H B H B B B B B H B B B B B B B B
Aradu.A01 1638873 B H B B H B B B B B B B H H H B B B B B H B B
Aradu.A01 1638907 B H B B H B B B H B B B H H H B B B B B H B B
谁能帮我写一个 awk 代码，它只能获取包含“A”和“B”字段的行？ 不考虑
1) 仅“A”和“H”、 2) 仅“B”和“H”的行。
每个都必须同时具有 A 和 B。如果 H 也与 A 和 B 一起出现，则还应考虑该行。总之，只需要包含“A”和“B”的行，如果“H”与“A”和“B”一起存在，那么还应该考虑该行：
NR>1 {for(i=3;i<=NF;i++)
{ if ( $i ~ "A" && $i ~ "B" && $1 ~ "H" ) ;
} ## if ;
## for loop is done
print ;
上面的代码返回输出文件作为输入文件。 }
答案1
您的脚本有几个问题：
- 它测试任何字段是否匹配两个“A”和“B”，同时。只要字段只有一个字符（所以你不能得到“AB”、“BAA”等），这永远不会是真的。
- 它正在寻找, 无论是否出现
H并不重要H - 每次循环时它都会在（第一个字段）
H中寻找$1 - 所有这些测试的结果都没有区别：
if测试没有匹配的操作。print对于每条线，总能达到。
追踪 A和B 出现在同一行（在不同的字段中），您可以为每个使用一个变量：
NR>1 {
#beginning of line - no As or Bs seen yet
A=0
B=0
#looping over all fields except the first two
#break as soon as both A and B found
for(i=3; A*B == 0 && i<=NF; i++) {
if ( $i ~ "A" ) A=1
if ( $i ~ "B" ) B=1
}
#print line if A and B were found
if (A && B) print
}
答案2
这不是一个awk解决方案，但这grep似乎可以解决问题：
egrep '^Aradu\.[A-Z][0-9]{2}.*A.*B|^Aradu\.[A-Z][0-9]{2}.*B.*A' aradu
Aradu.A01 463100 B B A A A A A H B A A H H H H H B A B A H H A
Aradu.A01 1089311 A H H H H A A A H A H B A H H H H H A A H H H
aradu你的示例文件在哪里。
编辑，正则表达式的细分：
^Aradu\.[A-Z][0-9]{2}= 以“Aradu”开头的行，后跟文字“。”，后跟任意大写字符，后跟任意整数两次。
.*A.*B= 后跟任意字符，任意次数（.*），后跟文字“A”，后跟文字“B”
|= 逻辑或。
（直到表达式的开头相同）
.*B.*A= 任意字符，重复任意次数，后跟文字“B”，后跟文字“A”。
grep没有&&（逻辑与）运算符，这是您可以搜索的最接近的（据我所知）行A && B || B && A。