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连接两个具有不同字段编号的文件

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连接两个具有不同字段编号的文件

我有两个文件：s2.txt

14 3KC12828ACBA 
43 8DG59242BAAD 
25 8DG60566AAAF 
6 8DG60912AAAF

和pbas.txt：

3AG33662AAAC
3KC12828ACBA
8DG59242BAAD
8DG60349AAAC
8DG60565AAAG
8DG60566AAAF
8DG60568AAAC
8DG60912AAAF
8DG62635AAAC

在 UNIX 上使用 bash 我想加入文件以获得一个如下文件：

3AG33662AAAC
3KC12828ACBA 14
8DG59242BAAD 43
8DG60349AAAC
8DG60565AAAG
8DG60566AAAF 25
8DG60568AAAC
8DG60912AAAF 6
8DG62635AAAC

怎样才能做到呢？

答案1

这就是join：

join -2 2 -a 1 pbas.txt s2.txt

选项说：

  • -2 2：第二个文件使用第二列来存储密钥
  • -a 1：输出文件 1 中的所有行，即使文件 2 中没有匹配项。

答案2

AWK

在 awk 中实现这一点相当容易：

$ awk 'NR==FNR{a[$2]=$1; next}{print $1,a[$1]}' file1.txt file2.txt    
3AG33662AAAC
3KC12828ACBA 14
8DG59242BAAD 43
8DG60349AAAC
8DG60565AAAG
8DG60566AAAF 25
8DG60568AAAC
8DG60912AAAF 6
8DG62635AAAC

没有什么特别的事情 - 这种技术经常被那些awk经常使用的人使用，特别是在处理多个文件时，它基于将信息从第一个文件加载到数组中的想法。

其工作原理很简单。首先使用NR==FNR（当前处理的行号和当前文件中的行号之间的比较）我们将所有内容file1.txt（在OP的示例中s2.txt）读取到关联值数组中。 next关键字允许我们在第一个文件中跳过下一个代码块。一旦我们退出第一个文件，下一个代码块将被执行，始终打印字段 1，并打印数组中的相应项（如果存在）。

珀尔

使用与 awk 类似的想法，我们可以在 Perl 中实现类似的结果，如下所示：

perl -lane 'if($F[1]){$hash{$F[1]}=$F[0]}else{print "$_ $hash{$_}"}' file1.txt file2.txt

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