我中断了挂起的常规软件更新，结果我的 Ubuntu 15.10 失去了很多常规系统功能，例如，它不再将文件写入 USB、播放声音或检测 WiFi。我猜还有更多我还没来得及注意的问题。
我将用 Ubuntu 16.04 替换发行版（并且已经备份了所有文件以做好准备）。
鉴于当前系统似乎已损坏/有故障，我在安装新的 Ubuntu 16.04 时是否应该选择清除并重新安装选项，或者升级以保留程序和文件？后一种选择是否会导致它保留导致上一个出现故障的问题？
答案1
如有疑问，全新安装总是更干净，并且比升级的系统出现的问题更少，即使旧版本运行良好。
正如您所说，旧版本已经很乱了，如果升级能够成功运行（根据您的解释，这听起来不太可能），它肯定不会解决任何问题，但会产生更多不起作用的东西。
不过，您可以尝试从 16.04 启动介质重新安装，并选择保留个人文件但重新安装系统。无论如何，请确保备份所有重要数据！
答案2
您已经备份了所有内容，但有时会忘记一些自定义脚本。我个人会先尝试升级路线，看看一切是否正常。如果不行，我会选择全新安装路线。Ubuntu 16.04 附带一个新内核 (4.4)。Ubuntu 15.10 内核 (4.2) 将被替换，这可能是您的 USB 问题的核心。
我相信对 Ubuntu 15.10 的支持将于 2016 年 7 月 28 日左右结束。即使不存在 USB 问题，您也应该尽快升级/全新安装 16.04。