我是 Gromacs 的新手，我尝试安装 5.0.2 版本并执行所有步骤，在执行 pdb2gmx 命令后，我几乎确信它已成功安装。但另一天我打开终端，在执行 mdrun -version 命令后，我遇到了这个错误：gromacs 版本是 4.6.6！我该怎么办？感谢您的时间
答案1
看来您的 mdrun 命令源自 gromacs-4.6.6 安装，这可能是 Ubuntu 中的预装版本。您需要使用 sudo apt-get remove gromacs* 卸载（删除）Ubuntu 中的 gromacs-4.6.6 版本
看看是否有效