我按照说明安装了 LAMMPS,但有一些问题。这些是说明(预构建的 Ubuntu Linux 可执行文件):
sudo add-apt-repository ppa:gladky-anton/lammps
sudo apt-get update
然后
sudo apt-get install lammps-daily
程序运行如下:
lammps-daily < in.lj
以下是一些问题:
必须从哪个目录提交作业才能运行?
我如何设置或者在哪里可以找到已提交作业的输出?
运行该程序的脚本在哪里?
我查看了 LAMMPS 相关文件的位置,发现了这些:(/usr/bin/lammps-daily
程序)和两个文件夹/usr/share/docs/lammps-daily
。/usr/share/docs/lammps-docs
也许我错过了一些基本的操作系统功能,没有阅读程序手册,或者我应该在这些文件之间浏览?
答案1
必须从哪个目录提交作业才能运行?
安装该程序后,您可以通过以下方式从任何目录调用它:
lmp_linux < /path/to/your/inputfile.txt
其中是inputfile.txt
您要运行的脚本。以下是有关如何编写输入脚本的一些信息。
我如何设置/在哪里可以找到已提交作业的输出?
您可以使用以下选项:
-日志档案
指定一个日志文件,供 LAMMPS 写入状态信息。在单分区模式下,如果不使用开关,LAMMPS 将写入文件log.lammps
。如果使用此开关,LAMMPS 将写入指定的文件。
运行该程序的脚本在哪里?
不太清楚你在这里所说的脚本是什么意思。如果你指的是输入脚本,这里bench
和目录中有一些示例脚本example
(解压后的源代码)。您可以查看更多教程这里。