如何抑制 gromacs 中的警告?

如何抑制 gromacs 中的警告?

我正在使用 gromacs 并且遇到了以下致命错误:

Fatal error:
Too many warnings (1).

If you are sure all warnings are harmless, use the -maxwarn option.

但是当我尝试添加此选项时,它看起来是一个无效选项。

我如何使用此选项?

答案1

只是阅读手册小心谨慎。上面写着:

-maxwarn选项可用于覆盖 gmx grompp 打印的警告,否则会停止输出。 在某些情况下,警告是无害的,但通常并非如此。建议用户在尝试使用此选项绕过输出消息之前仔细解释输出消息。

-maxwarn <int> (0)
输入处理期间允许的警告数。 不适合正常使用并且可能会产生不稳定的系统。

(重点是我的)

-maxwarn <int> (0)表示-maxwarn开关需要忽略的警告数,0这是默认值。因此请提供一个除 之外的数字0

答案2

Fatal error:
Too many warnings (2).

如果您确信所有警告都是无害的,请使用该-maxwarn选项。

我用的是这个:

gmx grompp -f minim.mdp -c XXXX.pdb -p topol_XXX.top -o XXXX.tpr -maxwarn 3

似乎警告的数量将决定用作-maxwarn选项的整数。

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