我为写这么长的问题深表歉意；但我被这个问题难住了，而且我不是一个高级 Linux 用户。我正在为我的从头组装工作。CLC Genomics Workbench 是一款经过许可的软件，它包含用于 DNA 序列读取的从头组装和 contigs 的下游分析的所有软件包。早上，当我检查进度时，屏幕上出现一条警告消息，上面写着：“根目录中的空间不足”。截至目前，组装的一个阶段称为“Contig 生成正在进行中”，该过程似乎停留在 14%。大约花了 24 小时才从 13% 的进度提高了 1%。
我的系统中的根目录/安装在 /dev/sda2 上。当我检查时，可用空间为 0%。我发现该/var/log/error_log文件占用了大部分磁盘空间，删除文件后释放了约 600 GB（但我观察到同一个文件的生成和填充速度更快）。当我阅读有关 CLC 服务器的信息时，它说临时文件占用了大量磁盘空间。这些临时文件是分析所必需的，这些临时文件被写入系统的默认临时目录。默认临时目录，我相信他们指的是/tmp。当我检查时/tmp，我发现了一个FASTA文件，大小约为 185 GB。
/tmp当我通过运行以下命令检查大小时，我得到的结果/tmp是174G。
当我跑步的时候df -h，输出显示所有文件的总大小tmpfs约为 174GB，但看起来它们尚未被充分利用（不超过 1%）。截至撰写此问题时，有/dev/sda2500GB 的可用空间。我很困惑，是否/tmp已经饱和 - 并且汇编程序无法再写入任何临时文件 - 这是汇编过程缺乏进展的原因。我该如何弄清楚并证实它？