等待一个或所有 LSF 作业完成

Question

和平台 LSF，是否有一个命令会等待特定作业或我提交的所有作业完成后再返回？换句话说，我正在寻找waitbash 中内置命令的 LSF 等效项。

Answer 1

如果您将-K选项设置为bsub，它将等待作业完成后再返回。然后，您可以bsub在 shell 中后台运行几个命令，并使用 shell 的wait命令等待它们。示例：

#!/bin/bash
bsub -K -o out.1 sleep 10 &
bsub -K -o out.2 sleep 5 &
wait

Answer 2

bwait

例子：

bsub -J 'myjobname' -o bsub.log bash -c 'date && sleep 10'
bwait -w 'ended(myjobname)'

等待bwait直到相应操作bsub完成。

相同的方法也适用于-K不支持的作业数组：

bsub -J 'myjobname[1-40]' -o 'bsub%I.log" 'sleep $JOBINDEX && echo $JOBINDEX'
bwait -w 'ended(myjobname)'

此外，ended()还有done()和exit()，分别bwait仅当退出状态为0或 不是时才成功退出0，否则会失败：

Wait condition is never satisfied

因为 LSF 对于这两种情况有不同的工作状态。

相关文档：

• https://www.ibm.com/support/knowledgecenter/en/SSWRJV_10.1.0/lsf_command_ref/bwait.1.html
• https://www.ibm.com/support/knowledgecenter/SSWRJV_10.1.0/lsf_command_ref/bsub.w.1.html#bsub_option_w

bsub -I

-K如果你只有一份工作，这是另一个不错的选择。例如：

bsub -I 'echo a;sleep 1;echo b;sleep 1;echo c'
echo done

将标准输出实时打印到终端，并且仅echo done在作业完成后运行。

记录于：https://www.ibm.com/docs/en/spectrum-lsf/10.1.0?topic=options-i