从文件中删除行

Question

我有 4 列、10000 行的数据。我正在尝试删除第二列的值小于前一行第三列的行。

chr1        10        20        3 
chr1        15        30        9 
chr1        55        60        1

Answer 1

awk '$2 >= prev; {prev=$3}' file.txt

解释

• awk <commands> file.txt：运行 awk file.txt。
• $2 >= prev：检查第二个字段是否$2大于或等于变量的内容prev。 （第一行未设置。）如果这是 true，则 awk 默认打印整行。 （即如果小于，则删除该行。）
• {prev=$3}：将第三个字段的内容存储$3在变量中prev。

然后对下一行重复此操作。 awk 会将第二个字段与 进行比较prev，后者现在包含前一行的第三个字段。有几点需要注意：

• 我不确定您想要第一行什么，所以我只是根据您的需要手动包含/排除它。
• 如果数据实际上是制表符分隔的，只需将以下标志添加到 awk 中以使其知道：-F'\t'。