.png)
请耐心等待，我刚刚开始使用虚拟机和 Linux。
我无法安装 BWA（关联) 在我的 Linux 虚拟机上。我尝试了几种方法，我找到的最完整的说明来自康奈尔大学，但我可能误解了他们想让我做什么。
我从 sourceforge 下载了最新版本 0.7.9a，并将其移动到我的主目录的一个文件夹中。该文件的路径是：
/home/jp/bwa/bwa-0.7.9a.tar.bz2
然后我解压了该文件：
bunzip2 bwa-0.7.9a.tar.bz2
然后解开文件：
tar xvf bwa-0.7.9a.tar
然后我进入我创建的新目录：
cd bwa-0.7.9a
然后我使用“make 命令”
make
这就是我被困住的地方：
终端打印此错误：
jp@jp-VirtualBox:~/bwa$ cd bwa-0.7.9a
jp@jp-VirtualBox:~/bwa/bwa-0.7.9a$ dir
bamlite.c bwase.c bwtsw2_aux.c kopen.c NEWS.md
bamlite.h bwase.h bwtsw2_chain.c kseq.h pemerge.c
bntseq.c bwaseqio.c bwtsw2_core.c ksort.h QSufSort.c
bntseq.h bwtaln.c bwtsw2.h kstring.c QSufSort.h
bwa.1 bwtaln.h bwtsw2_main.c kstring.h qualfa2fq.pl
bwa.c bwt.c bwtsw2_pair.c ksw.c README.md
bwa.h bwtgap.c ChangeLog ksw.h utils.c
bwa-helper.js bwtgap.h COPYING kthread.c utils.h
bwamem.c bwt_gen.c example.c kvec.h xa2multi.pl
bwamem_extra.c bwt.h fastmap.c main.c
bwamem.h bwtindex.c is.c Makefile
bwamem_pair.c bwt_lite.c kbtree.h malloc_wrap.c
bwape.c bwt_lite.h khash.h malloc_wrap.h
jp@jp-VirtualBox:~/bwa/bwa-0.7.9a$ make
gcc -c -g -Wall -Wno-unused-function -O2 -DHAVE_PTHREAD -DUSE_MALLOC_WRAPPERS utils.c -o utils.o
utils.c:33:18: fatal error: zlib.h: No such file or directory
#include <zlib.h>
^
compilation terminated.
make: *** [utils.o] Error 1
jp@jp-VirtualBox:~/bwa/bwa-0.7.9a$
我不知道如何处理这个错误。你们能提供一些关于需要做什么的见解吗？
我的第二个问题与康奈尔大学网站上提供的说明中的下一步有关。上面写道：
通过编辑 ~/.bashrc 并添加，将 bwa 添加到你的 PATH 中
export PATH=$PATH:/path/to/bwa-0.5.9"
我已将 .bashrc 放在我的主目录中（我可以在命令行中使用 ls -a 或在资源管理器中使用 ctrl+h 来查看它）。我不确定如何编辑文件以包含适当的代码行，即我是否只需将其粘贴到该文件中的任何位置？
我把他们的指示理解为我应该添加一些类似的东西
export PATH=$PATH:/home/jp/bwa/bwa-0.7.9a
但我不确定这是否正确。
我已经通过以下命令安装了更早的版本（0.5）。
get-apt install bwa
但是，我不想使用这个程序的过时版本。
如果你们能提供任何帮助我将非常感激。
谢谢，
主机操作系统：Windows 7 Home Premium（64 位）（Service Pack 1）
虚拟机软件：Oracle VirtualBox 版本 4.3.12
客户机操作系统：Ubuntu 14.02（32 位（我无法让 64 位运行）
答案1
看起来您缺少 ZLIB 头文件。
尝试：
sudo apt-get install zlib1g-dev
或者可能：
sudo apt-get install zlib-dev
第一个应该是正确的，但我没有 Ubuntu 机器可以测试它。
希望这能解决你的问题！
编辑
创建了一个 Ubuntu VM 并验证sudo apt-get install zlib1g-dev是正确的命令。