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我想在我的 PC 上安装 PyMOL。我昨天卸载了它，因为我之前通过 Python(x,y) 安装了 python 2.7.9，而我的 PyMOL 安装（几个月前安装的，所以我恐怕我忘了是怎么安装的）使用的是 python 2.7.8，结果 PyMOL 不再正常工作，例如，看看我截取的这个屏幕截图，GUI 分子查看器不可见，只有控制台。

在此处输入图片描述

我曾尝试使用wheels文件（即http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymolamd64 版本)，但我遇到了 pip 问题。查看我的 64 位 Python 2.7.9 安装附带的 pip，pip 的 exe 文件名为 pip2.exe。因此，我将系统环境变量更改PYTHONPATH为C:\Python27(python 安装所在的位置) 并将其更改PATH为C:\Python27\Scriptswhich is where pip2.exeis (以及 pip2.7.exe、easy_install.exe 和 easy_install-2.7.exe，如果相关)。然后我运行：

pip2 install pymol-1.7.2.1-cp27-none-win_amd64.whl

从命令提示符，但这给出了错误：

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python27\lib\runpy.py", line 162, in _run_module_as_main
    "__main__", fname, loader, pkg_name)
  File "C:\Python27\lib\runpy.py", line 72, in _run_code
    exec code in run_globals
  File "C:\Python27\Scripts\pip2.exe\__main__.py", line 5, in <module>
ImportError: No module named pip

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我卸载了 Python 并重新安装它（再次是 64 位），因为我怀疑我之前的安装中发生了一些错误（这次它附带的 pip 在 Scripts 文件夹中包含一个名为 pip.exe 的文件），然后我再次运行 pymol 安装命令（运行后pip install wheel-0.24.0-py2.py3-none-any.whl，从下载，使用此文件从https://pypi.python.org/packages/py2.py3/w/wheel/wheel-0.24.0-py2.py3-none-any.whl#md5=4c24453cda2177fd42c5d62d6434679a) 并收到不同的错误，pip.log 文件可能位于此处：http://goo.gl/ORVNPB。

进一步尝试

然后我下载了https://codeload.github.com/evonove/pymol/zip/1.7.4，提取其内容并运行

python setup.py 构建安装

输出结果如下：

running build
running build_py
running build_ext
building 'pymol._cmd' extension
Traceback (most recent call last):
  File "setup.py", line 349, in <module>
    data_files  = data_files
  File "C:\Python27\lib\distutils\core.py", line 151, in setup
    dist.run_commands()
  File "C:\Python27\lib\distutils\dist.py", line 953, in run_commands
    self.run_command(cmd)
  File "C:\Python27\lib\distutils\dist.py", line 972, in run_command
    cmd_obj.run()
  File "C:\Python27\lib\distutils\command\build.py", line 127, in run
    self.run_command(cmd_name)
  File "C:\Python27\lib\distutils\cmd.py", line 326, in run_command
    self.distribution.run_command(command)
  File "C:\Python27\lib\distutils\dist.py", line 972, in run_command
    cmd_obj.run()
  File "C:\Python27\lib\distutils\command\build_ext.py", line 337, in run
    self.build_extensions()
  File "C:\Python27\lib\distutils\command\build_ext.py", line 446, in build_exte
nsions
    self.build_extension(ext)
  File "C:\Python27\lib\distutils\command\build_ext.py", line 496, in build_exte
nsion
    depends=ext.depends)
  File "C:\Python27\lib\distutils\msvc9compiler.py", line 473, in compile
    self.initialize()
  File "C:\Python27\lib\distutils\msvc9compiler.py", line 383, in initialize
    vc_env = query_vcvarsall(VERSION, plat_spec)
  File "C:\Python27\lib\distutils\msvc9compiler.py", line 299, in query_vcvarsal
l
    raise ValueError(str(list(result.keys())))
ValueError: [u'path']

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