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使脚本可执行

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使脚本可执行

我正在尝试通过在任何地方输入程序名称（例如 usearch [options]）来执行程序（Usearch 或 samtools）。我正在运行 Ubuntu。

说明说“将二进制文件添加到您的路径以使其在命令行上可用”但我不知道这是什么意思或如何做到这一点。在线搜索带来了一些我完全无法理解的东西。

有人可以一步一步地告诉我如何做到这一点吗？

答案1

“将二进制文件添加到您的路径以使其在命令行上可用”

在 Unix 中，PATH是环境变量它定义了当您在命令行中输入可执行程序时，shell 在哪里查找要运行的可执行程序。如果您执行：

echo $PATH

您可以看到您的目录是什么样子。当您输入命令（如）时，将按顺序搜索PATH上的所有目录。例如，我的 $PATH 是：PATHls

.:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin

当我输入时，lsshell 会在（当前目录）中查找可执行文件.，然后在所有其他目录中查找，直到找到它，可能在 中/bin/ls。

您需要确保您的脚本是可执行的（chmod +x myscript），然后它需要位于PATH变量中的一个目录中。

在系统的 bin 目录中安装本地脚本和程序被认为是一种不好的做法。通常，我会将以下内容放入 shell 的启动配置文件中，但也.profile可能取决于 shell：.bashrc.zshrc

export PATH=$HOME/bin:$PATH

这会将您主目录中的个人 bin 目录添加到路径中，您可以在其中放置自己的脚本。一旦您更改了 shell 的配置文件，您将需要再次登录才能读取配置文件。

如果你想为系统上的所有用户安装你的脚本，那么放置脚本的最好位置是。你应该使用上述机制/usr/local/bin确保在你的路径中。/usr/local/bin

因此你需要：

  1. 使你的程序可执行（chmod +x my-program）
  2. 也许添加您自己的本地 bin 目录或者添加/usr/local/bin到PATH您的定义中.profile。
  3. 将其安装在您环境中的目录中PATH。

答案2

您需要将 bin 目录添加到您的 PATH 变量中。

如果您在终端中输入“echo $PATH”，它将显示一串路径。现在您需要知道程序的安装位置，并确保 PATH 包含适当的 bin 目录。尝试在终端中执行“PATH=$PATH:/Path-to-bin/”，现在您只需输入 Usearch 即可执行所需的程序。

为每个终端窗口将 bin 目录添加到 PATH 中可能会很烦人，幸运的是，.bashrc（位于 ~/）会在您打开新终端时运行。因此，您可以使用您最喜欢的编辑程序（即“vim ~/.bashrc”）将“PATH=$PATH://”行添加到 .bashrc。

.bashrc 是隐藏文件。因此输入“ls”不会列出 .bashrc，请尝试“ls -la”以查看 .bashrc 是否是您的主目录。

希望这会有所帮助，如果您有更多具体的问题，请告诉我。

祝你好运！

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