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perl：警告：设置语言环境失败。Centos 6.9

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perl：警告：设置语言环境失败。Centos 6.9

过去 15 天，我在 Centos Linux 服务器上收到以下错误消息。

perl: warning: Setting locale failed.
perl: warning: Please check that your locale settings:
        LANGUAGE = "en_US.utf8",
        LC_ALL = "en_US.utf8",
        LC_TYPE = "en_US.utf8",
        LANG = "en_US.utf8"
    are supported and installed on your system.
perl: warning: Falling back to the standard locale ("C").

我是一名生物信息学家，每当我运行 perl 或基于 perl 的应用程序（如 fastqc、bwa 和 samtools）时，它都会出现此错误并且不允许程序运行。

我尝试通过下列方式解决问题。

  1. 使用以下方式设置语言环境

    导出 LANGUAGE=en_US.UTF-8 导出 LC_ALL=en_US.UTF-8 导出 LANG=en_US.UTF-8 导出 LC_TYPE=en_US.UTF-8

  2. 重新安装 glibc

yum 重新安装 glibc-common

  1. sh -c "echo -e 'LANG=en_US.utf8\nLC_ALL=en_US.utf8' > /etc/default/locale"

这生成了一个我以前从未有过的区域设置文件/etc/default。

  1. localedef -i en_US -f UTF-8 en_US.UTF-8

localedef -i en_US -f UTF-8 en_US.UTF-8 localedef -v -c -i en_US -f UTF-8 en_US.UTF-8 localedef -c -i en_US -f UTF-8 en_US.UTF-8

  1. yum update

我现在的centos版本是6.9

gcc 版本是

gcc（GCC）4.4.7 20120313（红帽 4.4.7-18）

glibc 版本是

ldd --version
ldd (GNU libc) 2.12
Copyright (C) 2010 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.  There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
Written by Roland McGrath and Ulrich Drepper.

如果我使用 root 运行上述工具 fastqc/bwa/samtools，它可以正常运行，但如果没有超级用户，就会出现错误。

我不知道如何解决这个问题。非常感谢您的帮助。

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