我对这方面还是个初学者，所以我会尽可能详细地描述。我在 Ubuntu 中运行管道已经一天多了，刚刚不小心关闭了 Ubuntu 窗口。该管道是 Stacks 软件管道的一部分，用于从短读序列（遗传学、基因组学）构建基因座。它由不同的步骤组成，其中一些步骤已经成功执行。由于这些步骤需要很长时间才能执行，我想知道是否有命令可以让 Ubuntu 知道它在做什么并从中断的地方继续？请告诉我是否有任何方法可以让我继续，或者我是否应该从头开始重新运行。
答案1
恢复功能完全取决于应用程序。如果您还没有联系软件开发人员，我建议您尝试联系他们，因为他们将为您提供最佳答案。
我相信这是您描述的软件的开发者网站，您可以在这里找到一些联系信息： https://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/
他们的文档确实明确提到了“恢复”选项可能是您要寻找的，但如果没有熟悉该软件的人的输入，则运行该软件可能会导致数据丢失 - 所以我建议等待回复。
--resume — 从上次运行继续执行管道。
这是可以找到该命令的链接。
https://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/comp/denovo_map.php