需要帮助处理在 ImageJ 中打开的图像

需要帮助处理在 ImageJ 中打开的图像

我创建了一个宏(基于我见过的不同宏),它可以分析图片中的粒子区域,自动将结果窗口中的区域列复制到剪贴板,并显示一个窗口询问我是否要关闭所有窗口。

我想知道是否可以将此宏应用于在 ImageJ 中打开的图片并在单个结果窗口中获取所有结果(主要是区域)。我无法使用批处理功能,因为我的文件夹包含必须彼此分开分析的图片集(不同的微生物菌株),以便分别获取每个菌株的结果。

这是我目前的宏,我知道它很丑陋,但效果相当好:

run("8-bit");
run("Threshold...");
waitForUser;
getThreshold(lower,upper);
if (lower==-1)
    exit("Threshold was not set");
run("Convert to Mask");
run("Fill Holes");
run("Set Scale...", "distance=2.87 known=1 unit=µm global");
run("Analyze Particles...", "size=30-Infinity display exclude add");
close();
closeWin("ROI Manager");
closeWin("Threshold");
closeWin("Log");
String.resetBuffer;
  for (i=0; i<nResults; i++)
      String.append(getResult("Area", i) + "\n");
  String.copy(String.buffer);
waitForUser("Work done", "WORK DONE: Close all windows?");
if (isOpen("Results")) {
         selectWindow("Results"); 
         run("Close" );

function closeWin(winName)
{
    if (isOpen(winName)) 
    {
        selectWindow(winName);
        run("Close");
    }
}

答案1

最后我成功了,如果有人感兴趣的话,这里是代码:

for (i=1; i<=nImages; i++) {
    selectImage(i);
    run("8-bit");
    run("Threshold...");
    waitForUser;
    getThreshold(lower,upper);
    if (lower==-1)
        exit("Threshold was not set");
    run("Convert to Mask");
    run("Fill Holes");
    run("Set Scale...", "distance=2.87 known=1 unit=µm global");
    run("Analyze Particles...", "size=30-Infinity display exclude add");
}
close("*");
closeWin("ROI Manager");
closeWin("Threshold");
closeWin("Log");
String.resetBuffer;
  for (i=0; i<nResults; i++)
      String.append(getResult("Area", i) + "\n");
  String.copy(String.buffer);
waitForUser("Work done", "WORK DONE: Close all windows?");
if (isOpen("Results")) {
         selectWindow("Results"); 
         run("Close" );

function closeWin(winName)
{
    if (isOpen(winName)) 
    {
        selectWindow(winName);
        run("Close");
    }
}

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