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如何用另一个文件中的匹配字符串替换一个文件中的匹配字符串？

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如何用另一个文件中的匹配字符串替换一个文件中的匹配字符串？

我有一个这样的文件：

head cleandata.map
1   1:775852:T:C    0   775852
1   1:1120590:A:C   0   1120590
1   1:1145994:T:C   0   1145994
1   1:1148494:A:G   0   1148494
...

还有另一个文件：

head lifted.map
1   1:775852:T:C    0.0 785989
1   1:1120590:A:C   0.0 1130727
1   1:1145994:T:C   0.0 1156131
1   1:1148494:A:G   0.0 1158631
...

我想要得到的是更改 cleandata.map ，它看起来像这样：

1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631
...

因此，如果 lift.map 第 2 列中的行与 cleandata.map 第 2 列中的行匹配，请将 cleandata.map 第 2 列和第 4 列中的行替换为 lift.map 中第 4 列的值。

答案1

尝试

$ awk 'FNR==NR {T[$2] = $4; next} $2 in T {gsub ($4, T[$2])} 1' file2 file1
1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631

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