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排序用 NA 替换列值

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排序用 NA 替换列值

我一直在尝试对这个文件进行排序，但我的第一列中不断出现 NA，但我不知道为什么。

> head Coch_ATAC_peaks.bed
chr1    3181385 3181783
chr1    3389977 3390375
chr1    3456575 3456973
chr1    3661505 3661903
chr1    3903684 3904082
chr1    3916303 3916701
chr1    4316903 4317301
chr1    4322506 4322904
chr1    4402488 4402886
chr1    4416984 4417382

> sort -k 1,1V Coch_ATAC_peaks.bed | head
NA      1050187 1050585
NA      110317  110715
NA      127371  127769
NA      128207  128605
NA      13412   13810
NA      159542  159940
NA      193109  193507
NA      223382  223780
NA      233951  234349
NA      252365  252763

我最初是在 Windows PC 上制作这个文件的。我用 dos2unix 将其转换为 UNIX。你知道这些 NA 是从哪里来的吗？

答案1

请参阅 αГsнιn 的评论。我希望 NA 能够按顺序创建；然而它们一直存在于文件中。

> grep NA Coch_ATAC_peaks.bed
NA      2745    3143
NA      5650    6048
NA      9679    10077
NA      13412   13810
NA      39048   39446
NA      43021   43419
NA      55564   55962
NA      69578   69976
NA      110317  110715
NA      127371  127769

一旦 NA 被移除，上游就会 > sort -k 1,1 Coch_ATAC_peaks.bed 按预期工作。

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