如何对多个文件运行单个命令来转换文件格式？

Question

我正在尝试将文件格式转换为fa在Linux 终端上fq使用。seqkit命令很简单，如下所示。

seqkit fq2fa Std_metabat2_bin.9_sub.fa -o Std_metabat2_bin.9_sub.fq -j 20 

但是，我有超过 200 个文件（fa元基因组箱的文件），我想知道是否有比一次转换一个文件更好的方法。

Answer 1

一种解决方案是使用for循环来转换.fa目录中的所有文件：

for file in *.fa; do seqkit fq2fa "$file" -o $(basename "$file" .fa).fq -j 20; done