file1
我有一个名为以下信息的文件:
TCONS_00000011 XLOC_000003 - u q1:MSTRG.39|MSTRG.39.9|4|0.000000|0.000000|0.000000|7468
TCONS_00000012 XLOC_000004 - u q1:MSTRG.41|MSTRG.41.1|2|0.000000|0.000000|0.000000|1270
TCONS_00000013 XLOC_000003 - u q1:MSTRG.39|MSTRG.39.10|2|0.000000|0.000000|0.000000|6835
TCONS_00000014 XLOC_000003 - u q1:MSTRG.39|MSTRG.39.11|2|0.000000|0.000000|0.000000|880
TCONS_00000015 XLOC_000003 - u q1:MSTRG.39|MSTRG.39.12|3|0.000000|0.000000|0.000000|377
TCONS_00000016 XLOC_000005 - u q1:MSTRG.2|MSTRG.2.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|709
TCONS_00000017 XLOC_000006 - u q1:MSTRG.4|MSTRG.4.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|343
TCONS_00000018 XLOC_000007 - u q1:MSTRG.40|MSTRG.40.1|7|0.000000|0.000000|0.000000|12112
TCONS_00000019 XLOC_000007 - u q1:MSTRG.40|MSTRG.40.2|2|0.000000|0.000000|0.000000|310
TCONS_00000020 XLOC_000007 - u q1:MSTRG.40|MSTRG.40.3|3|0.000000|0.000000|0.000000|538
TCONS_00000021 XLOC_000008 - u q1:MSTRG.42|MSTRG.42.1|9|0.000000|0.000000|0.000000|6331
TCONS_00000022 XLOC_000008 - u q1:MSTRG.42|MSTRG.42.2|5|0.000000|0.000000|0.000000|1311
TCONS_00000023 XLOC_000008 - u q1:MSTRG.42|MSTRG.42.3|5|0.000000|0.000000|0.000000|923
TCONS_00000024 XLOC_000008 - u q1:MSTRG.42|MSTRG.42.4|2|0.000000|0.000000|0.000000|455
TCONS_00000025 XLOC_000009 - u q1:MSTRG.7|MSTRG.7.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|232
TCONS_00000026 XLOC_000010 - u q1:MSTRG.6|MSTRG.6.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|483
TCONS_00000027 XLOC_000011 - u q1:MSTRG.12|MSTRG.12.1|2|0.000000|0.000000|0.000000|2489
TCONS_00000028 XLOC_000012 - u q1:MSTRG.14|MSTRG.14.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|7604
TCONS_00000029 XLOC_000013 - u q1:MSTRG.55|MSTRG.55.1|4|0.000000|0.000000|0.000000|1511
如下file2
所示:
XLOC_000005
XLOC_000007
XLOC_000009
XLOC_000010
XLOC_000012
根据来自的信息file2
是否与file1
我想从中提取所有信息的第二列匹配file1
。输出应如下所示:
TCONS_00000016 XLOC_000005 - u q1:MSTRG.2|MSTRG.2.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|709
TCONS_00000018 XLOC_000007 - u q1:MSTRG.40|MSTRG.40.1|7|0.000000|0.000000|0.000000|12112
TCONS_00000019 XLOC_000007 - u q1:MSTRG.40|MSTRG.40.2|2|0.000000|0.000000|0.000000|310
TCONS_00000020 XLOC_000007 - u q1:MSTRG.40|MSTRG.40.3|3|0.000000|0.000000|0.000000|538
TCONS_00000025 XLOC_000009 - u q1:MSTRG.7|MSTRG.7.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|232
TCONS_00000026 XLOC_000010 - u q1:MSTRG.6|MSTRG.6.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|483
TCONS_00000028 XLOC_000012 - u q1:MSTRG.14|MSTRG.14.1|1|0.000000|0.000000|0.000000|7604
我该如何做这个Linux?
答案1
这可能就是您想要的:
awk 'NR==FNR{a[$1]; next} $2 in a' file2 file1