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awk 不将字段识别为数字

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awk 不将字段识别为数字

我认为这是一个简单的问题，但我不明白发生了什么。我有一个文件，例如

Scaffold_19:10402053-10402986   Scaffold_33:25064012-25064819   92.806  278 5   5   8   279 269 1   2.84e-107   388
Scaffold_6:54625155-54625833    Scaffold_33:6634011-6634353 96.774  248 6   2   1   248 97  342 1.21e-114   412
Scaffold_9:94800251-94801152    Scaffold_26:56326990-56327448   100.000 297 0   0   1   297 162 458 1.19e-155   549
Scaffold_20:79074547-79075122   Scaffold_20:79075175-79076351   93.269  208 11  3   1   208 972 1176    6.43e-82    303
Scaffold_18:6685836-6686898 Scaffold_19:81178714-81179662   99.789  949 1   1   114 1062    1   948 0.0 1740
Scaffold_18:46725018-46726185   Scaffold_18:46723864-46724938   84.309  752 73  29  1   710 323 1071    0.0 693
Scaffold_9:97974338-97975523    Scaffold_9:97976642-97978267    90.239  1045    81  18  155 1185    1   1038    0.0 1345
Scaffold_16:35667544-35671350   Scaffold_34:16160847-16161438   99.459  185 0   1   1   184 185 1   1.56e-90    335
Scaffold_33:47202231-47202984   Scaffold_33:47205382-47206652   94.763  611 31  1   3   613 642 1251    0.0 950
Scaffold_8:18583199-18586799    Scaffold_25:14231844-14235013   98.460  3116    43  3   1   3112    55  3169    0.0 5483

现在，我想做的就是将第三列 <= 的行打印为数字。那应该很容易吧？例如，打印 $3 <= 100 的行

head q.filtered.noself.blastn|awk '$3 <= 100'

但它什么也没返回！你能帮我吗？就像 awk 无法识别第三个字段是数字一样。

我在 Ubuntu 20.04.2 上使用 mawk 1.3.4 20200120

这是文件的示例 样本

编辑：这是语言环境的输出

locale
LANG=en_GB.UTF-8
LANGUAGE=en_GB:en
LC_CTYPE="en_GB.UTF-8"
LC_NUMERIC=fr_BE.UTF-8
LC_TIME=fr_BE.UTF-8
LC_COLLATE="en_GB.UTF-8"
LC_MONETARY=fr_BE.UTF-8
LC_MESSAGES="en_GB.UTF-8"
LC_PAPER=fr_BE.UTF-8
LC_NAME=fr_BE.UTF-8
LC_ADDRESS=fr_BE.UTF-8
LC_TELEPHONE=fr_BE.UTF-8
LC_MEASUREMENT=fr_BE.UTF-8
LC_IDENTIFICATION=fr_BE.UTF-8
LC_ALL=

答案1

问题是你有LC_NUMERIC=fr_BE.UTF-8.在此区域设置下，小数点分隔符为,且不是，.因此98.9不被视为数字。为了显示：

$ echo "98.5" | LC_NUMERIC=C mawk '$1<100' 
98.5
$ echo "98.5" | LC_NUMERIC=fr_BE.UTF-8 mawk '$1<100' 
$

因此，要么将您的区域设置更改为具有.小数点分隔符的区域设置，要么为此命令显式设置区域设置：

head q.filtered.noself.blastn | LC_NUMERIC=C awk '$3 <= 100'

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