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awk 按分隔符分割并取第一个条目

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awk 按分隔符分割并取第一个条目

我有这样的输入：

chr1    28374C       T       0.0     PASS    AF=0.730769;AO=19;DP=26;
chr1    29631A       G       0.0     PASS    AF=0.6;AO=6;DP=10;
chr1    39322CAC    ACC      0.0     PASS    AF=0.266667,0.266667;AO=4,4;DP=16;

我想取第一个AF=[0-9]。我设法用“;”分隔该列但我不知道如何只获取第一个条目。所以我使用了 awk：

cat file | awk '{split($6,a,";"); print a[1]}'

这使：

AF=0.730769
AF=0.6
AF=0.266667,0.266667

但我只想：

AF=0.730769
AF=0.6
AF=0.266667

答案1

awk 的函数采用正则表达式作为分隔符，因此您可以使用同时包含和 的split正则表达式：;,

awk '{split($6,a,/[;,]/); print a[1]}' file

（不需要cat和|）。您还可以使用不同的分隔符拆分两次：

awk '{split($6,a,/;/); split(a[1],b,/,/); print b[1]}' file

答案2

$ awk -F'[[:space:],;]+' '{print $6}' file
AF=0.730769
AF=0.6
AF=0.266667

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