☰

由于我无权访问根服务器，如何在家庭空间上安装 FASTQC

tag-icon • tag-icon linux java download bioinformatics
由于我无权访问根服务器，如何在家庭空间上安装 FASTQC

我正在尝试对一些数据运行 FASTQC。我正在一台没有 root 访问权限的服务器上工作。有谁知道我可以在我的家庭空间中安装 fastqc 的方法，因为我在服务器上没有 root 权限并解压缩文件？

答案1

使用conda安装fastqc。我更喜欢conda为单独的工具使用单独的环境，但是 YMMV。如果bioconda不包含在您的频道中，请将其永久添加，或将其添加到以下命令中：-c bioconda。

例子：

# Install the most recent version of fastqc in environment 
# called also "fastqc" (or use a different name):

conda create -n fastqc fastqc

# Install a specific version of fastqc into its own environment:

conda create -n fastqc-0.11.9 fastqc=0.11.9

相关内容