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安装 Mac OS X El Capitan 后，knitr 无法在 LyX 上运行

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安装 Mac OS X El Capitan 后，knitr 无法在 LyX 上运行

我将 Mac 更新为 OS X El Capitan，但knitr无法使用。更新之前一切都很好。现在 LyX 提示：“模块 knitr 需要的软件包在您的 LaTex 安装中不可用”。但在更新之前它是可用的！

所以我无法编译我的文档。有人能帮我吗？

答案1

我在使用 El Capitan、knitr 和 TeXShop 时也遇到了同样的问题。该问题与 El Capitan 的新安全功能有关，这些功能限制了对 /usr 文件夹的访问。我重新安装了最新版本的 MacTeX 和 R，现在可以正常编译 knitr 文件了。

有关更多详细信息，请参阅此解释（尽管它没有涉及 knitr）：https://tug.org/mactex/UpdatingForElCapitan.pdf

答案2

由于 El Capitan 对 /usr 的写入限制，我也遇到了这个问题。重新下载 R 和 MacTex 确实解决了这个问题，如另一个答案中所述，但您可以通过在终端中输入以下内容来避免重新下载 MacTex：

cd /Library/TeX
sudo ln -s Distributions/Programs/texbin texbin
echo "/Library/TeX/texbin" >~/Desktop/TeX
sudo cp ~/Desktop/TeX /etc/paths.d/TeX

不过，由于这些变化，Rscript 现在已经无法使用了。尝试在终端中检查：which Rscript。我不得不重新下载 R，但成功了。现在我which Rscript得到：

/usr/local/bin/Rscript

或者，尝试在 Rstudio 中运行，它可以直接访问 R。

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