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从 latex 运行 R 代码。（knitr 的替代品）

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从 latex 运行 R 代码。（knitr 的替代品）

如果您想将 R 脚本的输出导出到 latex 并创建 pdf 文档，您可以使用 RStudio 中的 Knitr 包。但我想这只是为了获得短期结果而采取的良好做法。

如果我想写一本书、一篇 1000 页的论文该怎么办？

你该如何做相反的事情？

我的意思是，我可以在乳胶文件中包含 R 代码并直接从 TexStudio+LaTex/LuaTex 运行它吗？（为了在 pdf 中获取数值结果和图形）。

如何？

新功能：有人说可以使用 knitr 生成大型文档。即使可以，我认为从特定平台（如 TexStudio）创建 LaTex 文档更舒适、更灵活。

那么，最佳做法是什么？混合两种方法？：使用 Knitr 生成文档的各个部分，然后使用 TexStudio 进行混合和修改？怎么做？

有类似的包列表旨在正确显示代码但不能运行它。

答案1

在 ConTeXt 中，您可以使用筛选此类任务的模块。事实上，过滤器模块是 ConTeXt MkII 模块的泛化先生，它是专门为您的要求而设计的。

但是，使用过滤器模块可以轻松复制任何语言的功能，因此没有 MkIV 版本的先生。

这是一个简单的例子：

\usemodule[filter]

\defineexternalfilter
  [R]
  [
     filtercommand={R CMD BATCH -q --save --restore \externalfilterinputfile\space \externalfilteroutputfile},
     output=\externalfilterbasefile.out,
     readcommand=\typefile,
     read=no,
     cache=yes,
   ]

\starttext
\startR
  ushape <- c(rexp(500000), 12-rexp(500000))
  pdf("ushape.pdf")
  par(mfrow=c(1,2))
  hist(ushape)
  plot(density(ushape), main="Density")
  dev.off()
\stopR

\startplacefigure[location=here, title={Output from R}]
  \externalfigure[ushape.pdf][height=0.5\textheight]
\stopplacefigure

\stoptext

这使

在此处输入图片描述

请注意，文件已被缓存，因此后续运行非常快。

答案2

但我猜这只是为了短期结果而采取的一种好做法。

我认为这是一个错误的前提。我从来没有写过 1000 页的书，但我写过几份统计报告，有些接近 100 页，只有两栏，只有几段 LaTeX 文本，但有几十张表格 (xtables)、几十种不同类型的图表和几十个统计结果，所有这些都是由 R 块在一个文件中生成的，存在与较短文档相同的问题。

有了这样的经验，对我来说，规则恰恰相反：文档越大，Sweave/knitr块的便利性就越高（使用 Rstudio、LyX 或 TeXworks，这不是问题）。

如果预览中的编译时间太长，请尝试使用cache=TRUE并knitr考虑尽可能主要处理最终文档的子集。但是，我从来不需要这些解决方法，因为编译时间只够眼睛休息一下。

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