Fontspec、Sweave 和 MacTeX 2016：字体形状未定义

Question

当我用 编译以下 MWE 时xelatex，编译顺利，但收到此警告消息：Font shape T1/TimesNewRoman(0)/m/n undefined(Font) using T1/cmr/m/n instead。更新到 MacTeX 2016 后出现该问题（该问题从终端、TeXshop 和 TeXstudio 2.11.0 显示），如果我注释掉 Sweave 包，它不会显示。

梅威瑟：

\documentclass{article}

\usepackage{fontspec}
    \setmainfont{Times New Roman}

\usepackage{Sweave}

\begin{document}

ciao̥ʃ

\end{document}