☰

在迭代目录而不是路径时仅获取文件名

tag-icon • tag-icon bash shell-script
在迭代目录而不是路径时仅获取文件名 
$ script.sh -i /storage/testFile

-i存储 的路径/storage/testFile/。

我想迭代testFile.一切都很顺利，但我想让这段代码更清晰，并添加一个用于输出和其他检查的目录。

我的代码片段是：

for f in $inDir/*.vcf; do
    if [ -f $f ]; #check if file is true or exists
    then
    if [   ${f: -4} == ".vcf" ] # check if the file ends with .vcf
        then
        convert2annovar.pl -format vcf4 "$f" > ./"$f".avinput  #run my code
     fi
    fi
done

问题：

echo $f返回/storage/testFiles/test.vcf。如何仅test.vcf在循环迭代时获取for？

答案1

您需要使用basename：

Synopsis

basename NAME [SUFFIX]    
basename OPTION 

Description

Print NAME with any leading directory components removed. If
specified, also remove a trailing SUFFIX.

所以：

$ basename /storage/testFiles/test.vcf
test.vcf

另外，如果你需要相反的，你可以使用dirname：

$ dirname /storage/testFiles/test.vcf
/storage/testFiles

相关内容