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复制名称已替换的选定文件

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复制名称已替换的选定文件

我有一些文件夹：

oldA with A_1.aaa, A_2.aaa, A_1.bbb, A.def, A.ghi 
oldB with B_1.aaa, B_2.aaa, B_1.bbb, B.def, B.ghi
and so on

并需要将它们复制到另一个文件夹并进行选择。

我只想将 A.def 和 A​​.ghi 复制到 /newA，B 也是如此。我已经编写了一个脚本，但它不起作用。

for i in A B C D
do
  folder="new${i}"
  mkdir $folder;
  cp path/to/old${i}/${i}{.def,.ghi} $folder
  cd $folder; some commands
  cd ..
done

错误是cp: cannot stat ‘oldA/A{.def,.ghi}’: No such file or directory

但是，当我使用直接命令时cp path/to/oldA/A{.def,.ghi} newA，效果很好。我应该怎么办？

如果我只想复制A_1.aaa和A_2.aaa，过程会类似吗？

这实际上是我的脚本。

#!/bin/bash
folder="Disperse"
mkdir $folder
cp 3B7V.pdb $folder
cd $folder

#awk '$5 != "C"' 3B7V.pdb > 3B7V_temp.pdb
#awk '$4 != "C"' 3B7V_temp.pdb > AB.pdb
sed -n 403,1981p 3B7V.pdb > A.pdb
sed -n 1982,3586p 3B7V.pdb > B.pdb

cd ..;mkdir EM;cd EM
for i in A B
do 
  folder="${i}_EM"
  mkdir $folder
  cp ../em.mdp ../Disperse/${i}.pdb $folder
  cd $folder

  echo -e "\n4" | pdb2gmx -f ${i}.pdb -o ${i}.gro -water none
  grompp -f em.mdp -c ${i}.gro -p topol.top -o ${i}_em.tpr
  mdrun -v -deffnm ${i}_em
  #grompp -f em.mdp -c ${i}_em.gro -p topol.top -o ${i}_em_mead.tpr
  cd .. #at EM folder
done

cd ..;mkdir PQR;cd PQR
for i in A B
do
  folder="${i}_PQR"
  mkdir $folder
  cp ../EM/${i}_EM/${i}* $folder
  cd $folder

  editconf -f ${i}_em.gro -o ${i}_em.pdb
  awk '$1 != "REMARK"' ${i}_em.pdb > ${i}_temp.pdb
  pdb2pqr --ff=AMBER --apbs-input ${i}_temp.pdb ${i}.pqr -v > log_${i}
  #editconf -f ${i}_em_mead.tpr -mead ${i}_gro.pqr
  #for j in *.pqr; do sed 1,8d "$j" > ../"${j/.*}"_sed.pqr; done
  cd .. #at PQR folder
done

cd ..;mkdir APBS;cd APBS
for i in A B
do
  folder="${i}_APBS"
  mkdir $folder;ls
  cp ../PQR/${i}_PQR/${i}{.pqr,.in} $folder
  cd $folder

  abps ${i}.in
  cd .. #at APBS folder
done

另外，我还有一个问题在康索莱。我不知道它是否相关，但我也会在这里发布。

答案1

事实证明，我用来$ sh script运行脚本，而不是$ bash script。这大括号扩展需要 bash 才能运行。

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