将原子附加到 chemfig 中的环中心

Question

有时化学家想表示某物附着在 C 环上，但不指定其附着的确切位置，例如因为它是随机的。相反，他们会表示类似

（参见 R^1）。这也可以附着在环的中心或左下角的“芳香环”上。这可以在 中完成吗chemfig？

Answer 1

（自chemfigv1.56 以来，环的中心可以轻松地引用为节点名称。请参阅本答案末尾附近的更新。）

是的，chemfig可以做到这一点，但需要一些技巧（或高级用法？）。

\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}

\begin{document}
\chemfig{*6(-=-=-=)} \qquad
\chemfig{*6(-=(-[:150])-=-=)} \qquad
\chemfig{*6(-=(-[:150]-[:120]-[:120]R^1)-=-=)} \qquad
\chemfig{*6(-=(-[:150]-[:120,.5]-[:120]R^1)-=-=)} \qquad
\chemfig{*6(-=(-[:150,,,,white]-[:120,.5,,,draw=none]-[:120]R^1)-=-=)}

\begin{enumerate}
  \item Start.
  \item Draw a bond to center with syntax \verb|-[<angle>]|.
  \item Draw two more bonds to get to the right angle, and add desired atom.
  \item Adjust bond length using syntax \verb|-[<angle>,<length scale>]|.
  \item Hide intermediate bonds by specifying a white drawing color, 
        using syntax \verb|-[<angle>,<length scale>,,,<tikz code>]|.
\end{enumerate}
\end{document}

更新

在下面的例子中，环内的弧被命名为A，因此环的中心是(A.center)。我不知道如何chemfig从任意坐标开始绘制键，所以我使用insert path。

限制：需要明确指定角度，就像36中的一样(36:5pt)。

\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}

\usetikzlibrary{calc}

\begin{document}
\chemfig{%
  **[,,draw=none, local bounding box=A]%
  5(-----%
    [,,,,{insert path={
      ([shift={(36:5pt)}]A.center) -- +(36:1cm) node[anchor=center, right] {X}
    }}]%
  )%
}
\end{document}

更新 2

使用chemfigv1.56 (或更新版本)，可以通过节点名称引用环的中心centrecycle<n>，请参阅chemfig手动的，第 12.6 节了解更多详情。感谢 的作者 Christian Tellechea chemfig。

下面的示例包含两幅\chemfig图。

• 在第一个中，以下添加了循环中心之间的绘图命令\chemmove，它不会扩展前一个的边界框\chemfig并且可能会与周围的文本重叠。
• 第二个将循环中心之间的绘图命令移动到tikz选项execute at end picture，以扩展边界框。

\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}
\usepackage{lipsum}

\tikzset{
  % helper style
  show bounding box/.style={
    execute at end picture={
      \draw[blue, #1] (current bounding box.north west) rectangle (current bounding box.south east);
    }
  }
}

\begin{document}
\lipsum[23]

Example from \verb|chemfig| manual, sec.\@ 12.6. Note \verb|\chemmove| won't extend the bounding box.

text
\chemfig[chemfig style={show bounding box}]{*6(-=-=-=)}%
\chemmove{
  \node[at=(cyclecenter1)] {.+}
   node[at=(cyclecenter1), shift=(120:1.75cm)] (end) {\printatom{R^1}};
  \draw[-, shorten <=.5cm] (cyclecenter1) -- (end);
}
text

Using \verb|execute at end picture|, the bounding box is correctly extended.

\tikzset{
  cycle center staff/.style={
    execute at end picture={
      \path (cyclecenter1) node[anchor=center] {.+}
           +(120:1.75cm)   node[inner sep=2pt] (end) {\printatom{R^1}};
      \draw (cyclecenter1) +(120:.5cm) -- (end);
    }
  }
}

text \chemfig[chemfig style={
  cycle center staff,
  show bounding box
}]{*6(-=-=-=)}
text

\lipsum[23]
\end{document}

更新 3

为了简化用户输入，\chempremove定义了一个新命令。使用此新命令，

\chempremove{<tikz drawing code>}
\chemfig{...}

相当于

\chemfige[chemfig style={execute at end picture={<tikz drawing code>}}]{...}

全面实施：

\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}
\usepackage{lipsum}
\usepackage{xpatch}

\tikzset{
  % helper style
  show bounding box/.style={
    execute at end picture={
      \draw[blue, #1] (current bounding box.north west) rectangle (current bounding box.south east);
    }
  }
}

% new command \chempremove{<tikz code executed at end picture>}
\catcode`\_=11\relax

\defKV[chemfig]{%
  at end picture        = \def\CF_atendpic_once{#1},
  at end picture append = \CF_addtomacro\CF_atendpic_once{#1}
}
\setKVdefault[chemfig]{%
  at end picture        = {}
}

\newcommand{\chempremove}[1]{%
  \setKV[chemfig]{at end picture append={#1}}%
  \ignorespaces
}

\xpatchcmd\CF_chemfigb
  {baseline,}
  {baseline,%
   execute at end picture={\unexpanded\expandafter{\CF_atendpic_once}},}
  {}{\fail}

\xpatchcmd\CF_chemfigb
  {\let\CF_flipstate\CF_zero}
  {\let\CF_flipstate\CF_zero\let\CF_atendpic_once\empty}
  {}{\fail}

\catcode`\_=8\relax

\begin{document}
\lipsum[23]

Example from \verb|chemfig| manual, sec.\@ 12.6. Note \verb|\chemmove| won't extend the bounding box.

\chempremove{
  % show bounding box
  \draw[blue] (current bounding box.north west) rectangle (current bounding box.south east);
}

text
\chemfig[chemfig style={show bounding box}]{*6(-=-=-=)}%
\chemmove{
  \node[at=(cyclecenter1)] {.+}
   node[at=(cyclecenter1), shift=(120:1.75cm)] (end) {\printatom{R^1}};
  \draw[-, shorten <=.5cm] (cyclecenter1) -- (end);
}
text

Using \verb|\chempremove|, the bounding box is correctly extended.

\chempremove{
  \path (cyclecenter1) node[anchor=center] {.+}
       +(120:1.75cm)   node[inner sep=2pt] (end) {\printatom{R^1}};
  \draw (cyclecenter1) +(120:.5cm) -- (end);
  % show bounding box
  \draw[blue] (current bounding box.north west) rectangle (current bounding box.south east);
}

text \chemfig{*6(-=-=-=)} text

\lipsum[23]

\end{document}