当我写论文时，我通常使用一个包含定义的单独文件，并将图表放入一个单独的目录中。此外，我可能在论文目录中有图表和其他额外文件的来源。这在我想要将论文发送给期刊之前都很有效。然后我只想发送编译实际需要的文件。此外，许多期刊不接受目录，因此目录结构必须“扁平化”。
有没有可以做到这一点的工具? 该工具应在装有 MiKTeX 的 Windows 上运行，并且能够：
- 给定主源，文件将其复制到给定目录（我们称之为 TGDIR）
- 将所有包含的源文件复制到 TGDIR，如果它们位于另一个目录中，则重写包含命令。
- 将所有使用过的数字复制到 TGDIR，如果需要，再次重写包含命令
- 创建一个仅包含引用参考文献的 .bib 文件并将其复制到 TGDIR
- 如果该工具可以在主 TeX 树中找到 .bib 文件，那就太好了
- 更新源以便使用新的 .bib 文件
如果没有可以完成上述所有操作的工具，我也会很感激有关只能执行部分步骤的提示 - 那么它应该是命令行工具，这样我就可以在脚本中使用它们。
到目前为止，我已经找到了几个适用于 4. 的工具，但只有比比鱼在 Windows 上对我来说很管用，不需要编译（我也想要一些可以推荐给其他人的东西）。我知道 Jabref 也可以做到这一点，但我从命令行使用它时得到了不同的结果。
我还发现texdirflatten据称可以做到 1.-3.，但是它不能处理数字 - 而且 6 年来没有更新过...