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使用 awk 进行数据操作

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使用 awk 进行数据操作

我有一个以下格式的输入文件。

#track
chr11   61731756    61735132    FTH1    -
chr12   6643584 6647537 GAPDH   +
chr11   18415935    18429765    LDHA    +
chr12   21788274    21810728    LDHB    -
chr22   24236564    24237409    MIF +
chr4    6641817 6644470 MRFAP1  +
chr15   72491369    72523727    PKM -
chr10   73576054    73611082    PSAP    -
chr2    85132762    85133799    TMSB10  +
chr13   45911303    45915297    TPT1    -

我想要一个输出文件，其中如果第 5 列是 +，则从第 2 列减去 5000，然后将 2000 添加到第 3 列，以便输出以下内容

chr11   18410935    18431765    LDHA    +
chr2    85127762    85135799    TMSB10  +

如果第 5 列为“-”，则第 3 列加 5000，第 2 列减去 2000，得到以下输出

chr11   61729756    61740132    FTH1    -
chr12   21786274    21815728    LDHB    -

所以我希望输出的顺序与输入的顺序相同。我也想按原样输出第一行#track。

我想在 awk 中执行此操作。我该如何执行此操作。

答案1

这可能有效

awk '$5 == "+" {$2-=5000;$3+=2000}; $5 == "-"{$3+=5000;$2-=2000};{print}'  file

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