关于awk命令

关于awk命令

谁能告诉我如何使用awk命令在整个文件中添加特定单词。

数据看起来像这样:

Organism: ahy   
matching miRNAs 
    miR156a
    miR156b
    miR156c
    miR159
    miR167
    miR3512
    miR3519
    miR394

Organism: aly   
matching miRNAs 
    miR156a
    miR156b
    miR156c
    miR156d
    miR156e
    miR156f
    miR156g
    miR156h
    miR157a
    miR157b
    miR157c
    miR157d
    miR159a
    miR159b
    miR159c
    miR160a
    miR160b
    miR160c
    miR161

现在我希望输出看起来像这样:

Organism: ahy   
matching miRNAs 
ahy miR156a
ahy miR156b
ahy miR156c
ahy miR159
ahy miR167
ahy miR3512
ahy miR3519
ahy miR394

Organism: aly   
matching miRNAs 
aly miR156a
aly miR156b
aly miR156c
aly miR156d
aly miR156e
aly miR156f
aly miR156g
aly miR156h
aly miR157a
aly miR157b
aly miR157c
aly miR157d
aly miR159a
aly miR159b
aly miR159c
aly miR160a
aly miR160b
aly miR160c
aly miR161
aly miR162a
aly miR162b
aly miR163

请向我建议如何使用awk命令来执行此操作。我是初学者,我正在尝试,但没有找到如何在整个文件中添加特定单词。

答案1

是的,awk是完成此类任务的正确工具。假设所有数据都在一个文件中,如问题所示,请尝试:

awk '
  /^Organism:/  { prefix = $2 ; print ; next }
  /^matching/ || !NF  { print ; next }
  { print prefix, $1 }
'

答案2

我认为用sed, 比如:sed 's/\ / ahy /g'和更好sed 's/\ / aly /g'。它将替换ahy或 的任何空格字符aly

也可以awk,但我无法理解你的数据是如何存储的:-/

编辑:

尝试这个 awk '{if ($1=="Organism:") {word = $2; print $0} else { if ($1=="matching") {print $0} else {print word $0}} }' filename

答案3

按照要求执行awk

awk '/^Organism/{prefix=$2}/miR[0-9]{3}/{$0=prefix $0}1'

相关内容