重命名文件（删除一些不总是相同的字符）

Question

我有一些这样命名的文件：

DA1_ATGCATG_L001_R1.fastq.gz
Oeu43_TCATGAC_L004_R2.fastq.gz

我想删除第一个“_”之后的部分，但保留“_R”中名称的末尾以获得此：

DA1_R1.fastq.gz
Oeu43_R2.fastq.gz

我怎样才能做到这一点？

Answer 1

在bash或 POSIX中sh：

for file in *.fastq.gz; do
    mv -- "$file" "${file%%_*}_${file##*_}"
done

Answer 2

和zsh：

autoload zmv # best in ~/.zshrc
zmv '(*)_*(_R*)' '$1$2'

Answer 3

使用perl rename（prename在Ubuntu中命名）

prename 's/^([^_]*).*(_R.*)/$1$2/' *.fastq.gz