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从列中删除前三个字符

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从列中删除前三个字符

chr二号71865 72972 YBL081W。 + SGD 基因。 ID=YBL081W;名称=YBL081W;Ontology_term=GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150;注意=非必需%20蛋白质%20of%20unknown%20function%3B%20null%20mutation%20results%20in%20a%20decrease% 20in%20plasma%20membrane%20电子%20transport;dbxref=SGD:S000000177;orf_classification=未表征

我有一个 bed 文件，其中包含 gff 格式的许多基因数据。我需要从第一列中删除前 3 个字符，例如从第一列的 chrII 中删除 chr，并且只需要罗马数字。

我想看到这样的输出

二号71865 72972 YBL081W。 + SGD 基因。 ID=YBL081W;名称=YBL081W;Ontology_term=GO:0003674,GO:0005575,GO:0008150;注意=非必需%20蛋白质%20of%20unknown%20function%3B%20null%20mutation%20results%20in%20a%20decrease% 20in%20plasma%20membrane%20电子%20transport;dbxref=SGD:S000000177;orf_classification=未表征

答案1

此命令打印出 的每一行的第 4 到 500 个字符file.gff，从而删除前 3 个字符，并将结果保存在 中newfile.gff：

cut -c4-500 file.gff > newfile.gff

如果您的行长度超过 500 个字符，请相应地增加上限。

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