我有一堆目录,其中有 3 个具有不同名称的 .csv 文件。例如,在我的目录 aa bb cc dd 中,每个目录有 3 个文件:
aa: EA_sing_aa.csv EA_ska_aa.csv EA_tat_aa.csv
bb: EA_sing_bb.csv EA_ska_bb.csv EA_tat_bb.csv
cc: EA_sing_cc.csv EA_ska_cc.csv EA_tat_cc.csv
dd: EA_sing_dd.csv EA_ska_dd.csv EA_tat_dd.csv
我想将每个文件的名称添加到新列中作为每个文件的行名称,然后将所有 EA_sing*.csv 文件组合在一起,将所有 EA_ska*.csv 文件组合在一起,还将所有 EA_tat*.csv 文件组合在一起!我的输出只有 3 个文件:
1) EA_sing.csv ##the first column for the rows from EA_sing_aa.csv file
will be aa and for the rows from EA_sing_bb.csv will be bb
and for the rows from EA_sing_cc.csv will be cc..... ##
2) EA_ska.csv
3) EA-tat.csv
我怎样才能在 *nix 中做到这一点?谢谢
答案1
这是一个即兴回答:
for dir in $(ls ); do echo " $dir - this is the directory"; for csv in $(ls $dir/*csv); do cat $csv|sed -e "s/\(.*\)/$dir, \1/g"; done; done
然后您可以添加选项来指定文件名,例如
for myfile in EA_sing EA_ska EA-tat; do for csv in $(ls $dir/$myfile*)...
然后将它们通过管道传输到您选择的文件,例如
do cat $csv|sed -e "s/\(.*\)/$dir, \1/g" >> $(echo "$myfile_complete.csv")
然后可能会合并成这样的东西:
for dir in aa bb cc dd; do for file in EA_sing EA_ska EA_tat; do for myfile in $(ls $dir/$file*);do echo "parsing $myfile"; cat $myfile | sed -e "s/\(.*\)/$dir,\1/g" >> $(echo "$file\_combined.csv"); done; done; done
或者更重要的是:
for dir in $(ls -d */); do for file in $(ls $dir*csv); do echo "this is my file $file"; cat $file|sed -e "s|\(.*\)|$(echo $dir|sed -e 's/\///g'), \1|g";done; done
答案2
您还应该考虑使用find
- 另一种非常有用的方法 - 例如看看:
find . -name "*csv" -exec grep "" {} + | sed -e 's/:/,/g' -e 's/\.\///g'
这与此处描述的问题非常相似: 在多个 CSV 文件的每一行连接 CSV 文件内的文件名?
也可以看看:
https://stackoverflow.com/questions/5917413/cat-multiple-files-but-include-filename-as-headers
答案3
依赖文件名始终正确
for t in $(find . -iname "*.csv" | awk -F_ '{print $2}' | sort | uniq); do
awk -v OFS="," 'split(FILENAME,f,/[_.]/){print $0,f[4]}' $(find . -iname "*$t*.csv" | sort) > EA_$t.csv
done