由于可用空间碎片导致 ZFS 严重写入放大

由于可用空间碎片导致 ZFS 严重写入放大

我已经为 PostgreSQL 数据库设置了 ZFS RAID0。存储和实例位于 AWS EC2 和 EBS 卷中。

NAME   SIZE  ALLOC   FREE  EXPANDSZ   FRAG    CAP  DEDUP  HEALTH  ALTROOT
pgpool   479G   289G   190G         -    70%    60%  1.00x  ONLINE  -
  xvdf  59.9G  36.6G  23.3G         -    71%    61%
  xvdg  59.9G  34.7G  25.2G         -    70%    57%
  xvdh  59.9G  35.7G  24.2G         -    71%    59%
  xvdi  59.9G  35.7G  24.2G         -    71%    59%
  xvdj  59.9G  36.3G  23.6G         -    71%    60%
  xvdk  59.9G  36.5G  23.4G         -    71%    60%
  xvdl  59.9G  36.6G  23.3G         -    71%    61%
  xvdm  59.9G  36.6G  23.2G         -    71%    61%

之前,FRAG大多数设备的利用率为 80%,我们遭受了严重的写入 IOPS 问题。由于池容量之前利用率为 75%(400GB),因此为每个设备额外配置了 10GB(400GB + 80GB)。现在,利用率FRAG降至 70%。一个重要的指标是,现在对于相同的工作负载,写入 IOPS 要小得多。

在此处输入图片描述

根据 Cloudwatch 指标,在 EBS 大小增加后,主 PG 的写入 IOPS 从 4000 IOPS 大幅减少到 1200 - 1400 IOPS,从从属 PG 的 3000 IOPS 减少到 600 IOPS。我怀疑这是由于FRAG写入放大方式造成的,如本文所述回答

我们已将设置recordsize=128K为比compressratio好得多recordsize=8K。我认为由于较高recordsizeFRAG因此会快速增加并导致写入放大和大量写入 IOPS。减少记录大小是否会阻止写入放大或我遗漏的任何其他问题?

数据库信息

PostgreSQL 9.6
Checkpoint Timeout: 10min
Total Databases: ~1100
Tables / DB: ~1300
Files / DB: ~6000 to 8000 (1300 Tables + Indexes + Toast)
Total Files for All DBs: ~7.7m

平均每 5 分钟,大约有 60000 到 70000 个文件(表 + 索引 + Toast)会受到影响(根据 postgres 检查点完成日志)。那么需要针对大量文件进行任何调整吗?或者至少我希望的是,当向池中添加额外空间时,IOPS 会有巨大差异的原因是什么?

此外,一个月前,当向池中添加更多空间时,我也看到了同样的 IOPS 差异,但两天后又恢复了高 IOPS 率。所以我猜同样的情况会在两到三天后重复出现,这就是为什么我怀疑自由空间碎片FRAG是罪魁祸首..!!

ZPOOL 道具

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo zpool get all
NAME    PROPERTY                       VALUE                          SOURCE
pgpool  size                           479G                           -
pgpool  capacity                       60%                            -
pgpool  altroot                        -                              default
pgpool  health                         ONLINE                         -
pgpool  guid                           1565875598252756833            -
pgpool  version                        -                              default
pgpool  bootfs                         -                              default
pgpool  delegation                     on                             default
pgpool  autoreplace                    off                            default
pgpool  cachefile                      -                              default
pgpool  failmode                       wait                           default
pgpool  listsnapshots                  off                            default
pgpool  autoexpand                     on                             local
pgpool  dedupditto                     0                              default
pgpool  dedupratio                     1.00x                          -
pgpool  free                           190G                           -
pgpool  allocated                      289G                           -
pgpool  readonly                       off                            -
pgpool  ashift                         0                              default
pgpool  comment                        -                              default
pgpool  expandsize                     -                              -
pgpool  freeing                        0                              -
pgpool  fragmentation                  71%                            -
pgpool  leaked                         0                              -
pgpool  multihost                      off                            default
pgpool  feature@async_destroy          enabled                        local
pgpool  feature@empty_bpobj            enabled                        local
pgpool  feature@lz4_compress           active                         local
pgpool  feature@multi_vdev_crash_dump  enabled                        local
pgpool  feature@spacemap_histogram     active                         local
pgpool  feature@enabled_txg            active                         local
pgpool  feature@hole_birth             active                         local
pgpool  feature@extensible_dataset     active                         local
pgpool  feature@embedded_data          active                         local
pgpool  feature@bookmarks              enabled                        local
pgpool  feature@filesystem_limits      enabled                        local
pgpool  feature@large_blocks           enabled                        local
pgpool  feature@large_dnode            enabled                        local
pgpool  feature@sha512                 enabled                        local
pgpool  feature@skein                  enabled                        local
pgpool  feature@edonr                  enabled                        local
pgpool  feature@userobj_accounting     active                         local

ZFS 道具

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo zfs get all
NAME    PROPERTY              VALUE                  SOURCE
pgpool  type                  filesystem             -
pgpool  creation              Mon Oct  8 18:45 2018  -
pgpool  used                  289G                   -
pgpool  available             175G                   -
pgpool  referenced            288G                   -
pgpool  compressratio         5.06x                  -
pgpool  mounted               yes                    -
pgpool  quota                 none                   default
pgpool  reservation           none                   default
pgpool  recordsize            128K                   default
pgpool  mountpoint            /mnt/PGPOOL            local
pgpool  sharenfs              off                    default
pgpool  checksum              on                     default
pgpool  compression           lz4                    local
pgpool  atime                 off                    local
pgpool  devices               on                     default
pgpool  exec                  on                     default
pgpool  setuid                on                     default
pgpool  readonly              off                    default
pgpool  zoned                 off                    default
pgpool  snapdir               hidden                 default
pgpool  aclinherit            restricted             default
pgpool  createtxg             1                      -
pgpool  canmount              on                     default
pgpool  xattr                 sa                     local
pgpool  copies                1                      default
pgpool  version               5                      -
pgpool  utf8only              off                    -
pgpool  normalization         none                   -
pgpool  casesensitivity       sensitive              -
pgpool  vscan                 off                    default
pgpool  nbmand                off                    default
pgpool  sharesmb              off                    default
pgpool  refquota              none                   default
pgpool  refreservation        none                   default
pgpool  guid                  571000568545391306     -
pgpool  primarycache          all                    default
pgpool  secondarycache        all                    default
pgpool  usedbysnapshots       0B                     -
pgpool  usedbydataset         288G                   -
pgpool  usedbychildren        364M                   -
pgpool  usedbyrefreservation  0B                     -
pgpool  logbias               throughput             local
pgpool  dedup                 off                    default
pgpool  mlslabel              none                   default
pgpool  sync                  standard               default
pgpool  dnodesize             legacy                 default
pgpool  refcompressratio      5.07x                  -
pgpool  written               288G                   -
pgpool  logicalused           1.42T                  -
pgpool  logicalreferenced     1.42T                  -
pgpool  volmode               default                default
pgpool  filesystem_limit      none                   default
pgpool  snapshot_limit        none                   default
pgpool  filesystem_count      none                   default
pgpool  snapshot_count        none                   default
pgpool  snapdev               hidden                 default
pgpool  acltype               off                    default
pgpool  context               none                   default
pgpool  fscontext             none                   default
pgpool  defcontext            none                   default
pgpool  rootcontext           none                   default
pgpool  relatime              off                    default
pgpool  redundant_metadata    most                   local
pgpool  overlay               off                    default

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ cat /proc/spl/kstat/zfs/arcstats
13 1 0x01 96 4608 8003814189 8133508755293587
name                            type data
hits                            4    48883641586
misses                          4    1321425301
demand_data_hits                4    15606800719
demand_data_misses              4    786648720
demand_metadata_hits            4    32729793033
demand_metadata_misses          4    278006868
prefetch_data_hits              4    315020107
prefetch_data_misses            4    207366277
prefetch_metadata_hits          4    232027727
prefetch_metadata_misses        4    49403436
mru_hits                        4    10685966527
mru_ghost_hits                  4    85159850
mfu_hits                        4    37807765384
mfu_ghost_hits                  4    40046050
deleted                         4    960331018
mutex_miss                      4    15489677
access_skip                     4    17626
evict_skip                      4    21812713742
evict_not_enough                4    267500438
evict_l2_cached                 4    0
evict_l2_eligible               4    108797848903680
evict_l2_ineligible             4    2000957528064
evict_l2_skip                   4    0
hash_elements                   4    313401
hash_elements_max               4    769926
hash_collisions                 4    587807552
hash_chains                     4    11108
hash_chain_max                  4    6
p                               4    3794526616
c                               4    7022898344
c_min                           4    1004520576
c_max                           4    16072329216
size                            4    6944858120
compressed_size                 4    3732648960
uncompressed_size               4    20043857408
overhead_size                   4    1682603008
hdr_size                        4    110128312
data_size                       4    3359916544
metadata_size                   4    2055335424
dbuf_size                       4    246193488
dnode_size                      4    943126912
bonus_size                      4    230157440
anon_size                       4    33360384
anon_evictable_data             4    0
anon_evictable_metadata         4    0
mru_size                        4    3718656000
mru_evictable_data              4    1940126208
mru_evictable_metadata          4    224441856
mru_ghost_size                  4    1684268032
mru_ghost_evictable_data        4    0
mru_ghost_evictable_metadata    4    1684268032
mfu_size                        4    1663235584
mfu_evictable_data              4    1288254464
mfu_evictable_metadata          4    83499008
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豬類

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo zdb -C pgpool

MOS Configuration:
        version: 5000
        name: 'pgpool'
        state: 0
        txg: 4739409
        pool_guid: 1565875598252756833
        errata: 0
        hostname: 'ip-10-0-1-59'
        com.delphix:has_per_vdev_zaps
        vdev_children: 8
        vdev_tree:
            type: 'root'
            id: 0
            guid: 1565875598252756833
            create_txg: 4
            children[0]:
                type: 'disk'
                id: 0
                guid: 1507251152420866879
                path: '/dev/xvdf1'
                whole_disk: 1
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                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1425
                create_txg: 4
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 129
                com.delphix:vdev_zap_top: 130
            children[1]:
                type: 'disk'
                id: 1
                guid: 12461793154748882472
                path: '/dev/xvdg1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 68
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1424
                create_txg: 9
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 131
                com.delphix:vdev_zap_top: 132
            children[2]:
                type: 'disk'
                id: 2
                guid: 15169312858460766498
                path: '/dev/xvdh1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 69
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1427
                create_txg: 12
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 133
                com.delphix:vdev_zap_top: 134
            children[3]:
                type: 'disk'
                id: 3
                guid: 8533762672700299025
                path: '/dev/xvdi1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 74
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1422
                create_txg: 15
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 71
                com.delphix:vdev_zap_top: 72
            children[4]:
                type: 'disk'
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                path: '/dev/xvdj1'
                whole_disk: 1
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                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
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                is_log: 0
                DTL: 1428
                create_txg: 18
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            children[5]:
                type: 'disk'
                id: 5
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                path: '/dev/xvdk1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 142
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                ashift: 9
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                com.delphix:vdev_zap_top: 141
            children[6]:
                type: 'disk'
                id: 6
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                path: '/dev/xvdl1'
                whole_disk: 1
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                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
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            children[7]:
                type: 'disk'
                id: 7
                guid: 19815078749163274
                path: '/dev/xvdm1'
                whole_disk: 1
                metaslab_array: 149
                metaslab_shift: 27
                ashift: 9
                asize: 64418480128
                is_log: 0
                DTL: 1423
                create_txg: 27
                com.delphix:vdev_zap_leaf: 147
                com.delphix:vdev_zap_top: 148
        features_for_read:
            com.delphix:hole_birth
            com.delphix:embedded_data

zfs.conf

ubuntu@ip-10-0-1-59:~$ sudo cat /etc/modprobe.d/zfs.conf
options zfs zfs_arc_max=77147180237

zdb 元板和空间图

zdb -m / -mm / -mmm

从 metaslabs 和 spacemap 信息来看,与上部区域相比,每个 vdev 末尾的 metaslabs 和 spacemaps 似乎有大量可用空间(由于最新的尺寸扩展)。所以这与解释的问题相关这里当元板和空间图碎片化时性能会如何下降。

我认为最好添加镜像并删除旧的 vdev,以便将新设备提升为主条带。这将有助于 metaslabs 和 spacemap,就好像它是一个没有太多碎片的新池一样(??? 不确定 !!!)。无论如何,这将作为最后的手段,在此之前,我将研究验证问题性质以及从 zfs 方面对 metaslabs/spacemap 所需的任何调整。

另外,为了减少碎片,计划将 zfs 日志设备添加到单独的设备,并将 postgres pg_xlog 目录移动到具有 ext4 分区的单独设备。

答案1

如果没有深入调试,很难给你一个明确的答案。无论如何,需要注意以下几点:

  • ZFS 通过以下方式分配块太空地图。当空间图的满度 >= 96%(旧版本为 80%)时,ZFS 将从首次适配分配器切换到最佳适配分配器。请注意,这是针对每个空间图的决定:您可能有一个 80% 满的池,而某些空间图的满度远高于该值,可能已经超过 96%。在写入此类空间图时,ZFS 将使用较慢的最佳适配分配器

  • 碎片化的空间图会比非碎片化的空间图占用更多的内存。这种增加的内存压力可能会导致空间地图破坏。您可以通过设置来避免这种情况metaslab_debug_load=1;如果不起作用,请尝试重新导入您的池和/或设置metaslab_debug_unload=1请注意,持久锁定内存中的所有空间图将不可避免地消耗更多 RAM

  • 你可能会被烫伤帮派街区但是,同样,如果不进一步调试,很难判断是否如此。 128K 的记录大小,以及如此好的compressratio,在碎片化方面肯定对你没有好处。 您可以阅读更多信息这里这里。

附注:我看到您的池有ashift=9。我认为纯 512B 设备现在非常罕见,尤其是在云环境中。为了提高性能,您可以/将使用重新创建池ashift=12

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