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拆分特定列的内容

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拆分特定列的内容

我需要将 my 第二列的内容分成file两列，例如：

Id  allele  id2
30  TC  12      
211 GG  12      
327 AA  13      
688 TC  15      
760 TT  18      
868 CC  90

输出应该是：

Id  allele1 allele2 id2
30  T   C   12      
211 G   G   12      
327 A   A   13      
688 T   C   15      
760 T   T   18      
868 C   C   90

答案1

和awk：

awk 'NR==1{$2=$2"1 "$2"2"} NR!=1{split($2,a,""); $2=a[1]" "a[2];}1' file
  • NR==1仅适用于第一行
    • $2=...：将第二个字段重新格式化为标题allele1 allele2
  • NR!=1适用于所有其他线路。
    • split($2,a,"")$2分割数组中的第二个字段a
    • $2=a[1]" "a[2];：使用两个分割值a[1]和重新格式化第二个字段a[2]。
  • 1最后的条件为真，打印awk整行（操作过的）

如果您希望将其列成列，请使用此awk ... | column -t.输出如下：

Id   allele1  allele2  id2
30   T        C        12
211  G        G        12
327  A        A        13
688  T        C        15
760  T        T        18
868  C        C        90

答案2

这是另一个sed：

sed '1!s/  *./&\t/;t
       s/a.*e/&1 &2/          
'    <infile >outfile

您可能需要使用实际的<制表符>字符而不是\t这里使用的转义符。

如果列按空间划分，则该方法有效。如果他们实际上是<制表符>字符划分列，那么它需要稍微改变。

sed '1!s/\t./&\t/;t
       s/a.*e/&1 &2/          
'    <infile >outfile

...与之前关于可能需要文字的注释相同<制表符>代替\反斜杠转义。

Id      allele1 allele2 id
30      T       C       12
211     G       G       12
327     A       A       13
688     T       C       15
760     T       T       18
868     C       C       90

答案3

$ cat file|sed -e 's,\([^ ]*\)[ ]*\(.\)\(.\),\1 \2 \3,' -e '1 s/a llele/allele1 allele2/'
Id allele1 allele2 id2
30 T C  12
211 G G  12
327 A A  13
688 T C  15
760 T T  18
868 C C  90

答案4

使用 Perl：

perl -lane '$,="  ";@F[1]=~s/./$&  /;print(@F)' in

 cat in
30  TC  12      
211 GG  12      
327 AA  13      
688 TC  15      
760 TT  18      
868 CC  90 
% perl -lane '$,="  ";@F[1]=~s/./$&  /;print(@F)' in
30  T  C  12
211  G  G  12
327  A  A  13
688  T  C  15
760  T  T  18
868  C  C  90

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