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构建 Python 包成功，但包构建不正确

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构建 Python 包成功，但包构建不正确

运行时python3 setup.py build它以这样的方式结束：

x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -g -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 build/temp.linux-x86_64-3.4/sklearn/linear_model/sag_fast.o -Lbuild/temp.linux-x86_64-3.4 -o build/lib.linux-x86_64-3.4/sklearn/linear_model/sag_fast.cpython-34m.so
running install_lib
creating /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/sklearn
error: could not create '/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/sklearn': Permission denied

当然它不能写入，/usr/local/lib/因为没有sudo使用。我对在这一步中使用 sudo 持谨慎态度。

这是结束sudo python3 setup.py install：

running install_egg_info
Writing /usr/local/lib/python3.4/dist-packages/scikit_learn-0.18.dev0.egg-info
running install_clib

在我看来很好。但是，当我尝试时，import sklearn我收到此错误：

$ python3
Python 3.4.3+ (default, Oct 14 2015, 16:03:50) 
[GCC 5.2.1 20151010] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import sklearn
Traceback (most recent call last):
File "/home/dotancohen/code/scikit-learn/sklearn/__check_build/__init__.py", line 44, in <module>
    from ._check_build import check_build
ImportError: No module named 'sklearn.__check_build._check_build'

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/home/dotancohen/code/scikit-learn/sklearn/__init__.py", line 56, in <module>
    from . import __check_build
File "/home/dotancohen/code/scikit-learn/sklearn/__check_build/__init__.py", line 46, in <module>
    raise_build_error(e)
File "/home/dotancohen/code/scikit-learn/sklearn/__check_build/__init__.py", line 41, in raise_build_error
    %s""" % (e, local_dir, ''.join(dir_content).strip(), msg))
ImportError: No module named 'sklearn.__check_build._check_build'
___________________________________________________________________________
Contents of /home/dotancohen/code/scikit-learn/sklearn/__check_build:
_check_build.c            setup.pyc                 __pycache__
_check_build.pyx          __init__.py               setup.py
___________________________________________________________________________
It seems that scikit-learn has not been built correctly.

If you have installed scikit-learn from source, please do not forget
to build the package before using it: run `python setup.py install` or
`make` in the source directory.

If you have used an installer, please check that it is suited for your
Python version, your operating system and your platform.
>>>

我应该python3 setup.py build和 一起跑吗sudo？这是在 Kubuntu Linux 15.10 上：

$ uname -a
Linux loathe 4.2.0-16-generic #19-Ubuntu SMP Thu Oct 8 15:35:06 UTC 2015 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

$ cat /etc/issue
Ubuntu 15.10 \n \l

请注意，Ubuntu 打包版本python-scikits-learn仅适用于 Python 2，我需要 Python 3。

答案1

我发现这个帖子其中提到配置要使用的 ATLAS（线性代数包）版本：

$ sudo update-alternatives --set libblas.so.3 /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3
$ sudo update-alternatives --set liblapack.so.3 /usr/lib/atlas-base/atlas/liblapack.so.3

之后，我很高兴地惊讶于事实上不再有权限问题，但我在构建时遇到了这个错误：

sklearn/__check_build/_check_build.c:4:20: fatal error: Python.h: No such file or directory

因此，我查看了结果aptitude search python | grep dev并决定以下软件包可能会有所帮助：

$ sudo aptitude install python3-numpy-dev python3.5-dev libpython3.4-dev

这样，包就正确构建了，scikit-learn 也正确导入了：

$ python3
Python 3.4.3+ (default, Oct 14 2015, 16:03:50) 
[GCC 5.2.1 20151010] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import sklearn
>>>

我不确定这三个包中的哪一个可能是关键包libpython3.4-dev，但问题已解决。

答案2

您应该清理（删除）本地安装并运行sudo apt-get install python-scikits-learn.它是为 debian 打包的，因此也将为 Ubuntu 及其衍生产品打包。

python 库的安装说明通常会告诉您手动安装。如果该库已经为您的发行版打包，那么这是一个错误 - 发行版包将比遵循网站上的某些安装说明更好地集成到系统中。

当你想要安装 python 库时，你应该做的第一件事是使用apt-cache search或 之类的工具aptitude search来查看它是否已经打包。如果是，请安装该软件包。如果不是，您可能最好使用deb-dry或使用debhelper工具来帮助您构建本地包，而不是遵循可能只在 lib 开发人员自己的特殊环境中工作的说明。

答案3

要解决该问题，您应该继续安装 - 这意味着再次运行构建，但sudo这次是。没有 sudo 就无法安装的原因是软件的安装过程（大多数时候）是这样的。

  1. 配置步骤 - 准备用于构建程序的文件。这不需要 root 权限。
  2. 构建步骤 - 编译程序，生成一些可执行文件和/或库。这不需要 root 权限。
  3. 安装 - 将库和/或可执行文件移动到操作系统中的目的地，以便其他程序可以使用它。

构建创建/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/sklearn以便其他程序可以使用它（例如 python 解释器），这就是您收到错误的原因。

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