原有域名文件在 下/home/account/public_html，附加域名在/home/account/add-on-domain。
两个站点都有一个.htaccess文件，除了域名之外，其他都相同，都在主目录中。
主域名：
Options +SymLinksIfOwnerMatch -FollowSymLinks -Indexes
RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^domain1.com [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://www.domain1.com/$1 [L,R=301]
添加域名：
Options +SymLinksIfOwnerMatch -FollowSymLinks -Indexes
RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^domain2.co.uk [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://www.domain2.co.uk/$1 [L,R=301]
中还有更多内容.htaccess，但附加组件根本无法读取。
Allowoverrides All在主域上添加会导致其崩溃，在添加域上不执行任何操作。
答案1
Options +SymLinksIfOwnerMatch -FollowSymLinks -Indexes
尝试将 AddOn 域设置FollowSymLinks为 而不是SymLinksIfOwnerMatch。例如：
Options +FollowSymLinks -Indexes
更新：
Allowoverrides All在主域上添加会导致其崩溃，在添加域上不执行任何操作。
这似乎意味着.htaccess插件域未启用覆盖，或者插件域指向的文件系统路径未启用覆盖。不幸的是，这需要访问服务器配置才能解决 - 您似乎无权访问。
您需要AllowOverride All向插件域的容器添加<VirtualHost>内容，以覆盖插件域指向的目录。例如：
<Directory /home/account/add-on-domain>
# Permit "All" .htaccess overrides for this directory tree
AllowOverride All
</Directory>
（当您在 cPanel 中创建附加域时，它应该已经为您执行此操作。）
子域/附加域是否放错了位置？
不，不一定。这取决于你具体在做什么。如果附加域要与主域完全分开，那么最好这样做。
例如它应该在 public_html 下吗？
这应该没什么关系。但是，如果您将附加域指向主域之外的子目录，那么.htaccess主域的文档根目录中的内容也会影响附加域。为了将它们分开，您需要将主域的内容移动到另一个子目录中，并将请求从文档根目录重写到此子目录（这些只是在您无权访问服务器配置时的解决方法）。
但是，这意味着.htaccess将为插件域启用覆盖，因为它们已为父目录启用。因此，除非服务器配置中的某些内容明确阻止此操作，否则也将为所有子目录启用覆盖。