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为什么当我尝试通过 pip 安装 SciPy 时，RHEL 上检测不到 ATLAS？

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为什么当我尝试通过 pip 安装 SciPy 时，RHEL 上检测不到 ATLAS？

我正在使用 RHEL6、Python 2.6.6，并尝试通过 pip 安装 SciPy。

[user@server ~]$ sudo pip install scipy
<snip>
atlas_blas_threads_info:
Setting PTATLAS=ATLAS
  libraries ptf77blas,ptcblas,atlas not found in ['/usr/local/lib64', '/usr/local/lib', '/usr/lib64/atlas']
  NOT AVAILABLE
<snip>

但是，当我列出 /usr/lib64/atlas 中的文件时：

[user@server ~]$ ls /usr/lib64/atlas
libcblas.so.3    libclapack.so.3.0  liblapack.so.3     libptcblas.so.3.0
libatlas.so.3    libcblas.so.3.0    libf77blas.so.3    liblapack.so.3.0  libptf77blas.so.3
libatlas.so.3.0  libclapack.so.3    libf77blas.so.3.0  libptcblas.so.3   libptf77blas.so.3.0

有任何想法吗？

答案1

Numpy 和 Scipy 是奇怪的野兽。最大的烦恼是Fortran ABI 不匹配等等。从安装页面：

如果你的 blas/lapack/atlas 是用 g77 构建的，那么在构建 numpy 和 scipy 时也必须使用 g77；

如果您的 atlas 是用 gfortran 构建的，那么您必须用 gfortran 构建 numpy/scipy。

ldd在您拥有的 Atlas 版本上运行。

如果 libg2c.so 是依赖项，则使用 g77，并且您需要在构建时传递这些选项：

python setup.py build --fcompiler=gnu

或者，如果 libgfortran.so 是一个依赖项，它是用 gfortran 构建的，您需要设置正确的 fortran 编译器：

python setup.py build --fcompiler=gnu95

附注：如果您的机器运行的处理器包含 SIMD 支持，我强烈建议安装优化版本的 atlas（例如 atlas3-sse）。

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