我最近获得了 MinION USB 基因组(DNA)测序仪,但令我失望的是,它似乎无法在 Ubuntu 中正常工作。
我使用的是 Ubuntu 12.04 版本。序列器可以通过随附的脚本/驱动程序正确检测到,但似乎无法检测到样本。
我附上了该过程的截图。如能提供任何帮助我将不胜感激!
答案1
鉴于脚本正确检测到了该设备,您的问题似乎更可能是基因测序仪方面的问题,而不是 Ubuntu 问题。是否有其他实用程序可让您与测序仪通信以获取任何其他功能,也许是校准程序?如果 Ubuntu 可以与机器通信并让它做其他事情,我认为问题出在基因测序仪上,而不是计算机。另一个可能的测试是尝试使用另一个操作系统(如果有可用的软件)。最后,确保您的测序仪具有最新的固件,并且您用于连接的软件是最新的。
答案2
大胆猜测:这可能是权限问题吗?某些设备在以普通用户身份运行时可以正常执行某些操作,但root
执行其他操作则需要特权。因此,您可以尝试sudo ./gseq
看看这是否有帮助。如果这有帮助,但您不想一直以普通用户身份运行root
,您可以跟踪设备文件并更改其权限,以便使用您的普通帐户访问设备。这可能涉及创建 udev 规则。我不会在这里讨论这个问题,因为这个解决方案有点牵强。
答案3
设备的 6 小时使用寿命是否可能已超过?这似乎更像是设备错误或流程问题。MinION 技术支持可能是您解决此问题的主要联系人,因为看起来程序确实正在与设备通信。
克里斯