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如何指定安装工具的路径？

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如何指定安装工具的路径？

我已经安装SRA 工具包在 ubuntu 下使用此命令sudo apt-get install sra-toolkit。现在我尝试使用它的一部分 -fastq-dump.2.1.7但我收到一个错误，我明白我没有指定该软件的路径。这很奇怪，因为我可以检查该软件的版本，它也被添加到/usr/bin/目录中。有人知道如何克服这个错误吗？代码如下

mkosinski@mkosinski-E540:~$ fastq-dump.2.1.7 ~/WCO/Kasia/SRR1294095.sra 
2015-10-19T20:52:13 fastq-dump.2.1.7 err: path incorrect while opening manager within database module - failed /home/mkosinski/WCO/Kasia/SRR1294095.sra
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mkosinski@mkosinski-E540:~$ fastq-dump.2.1.7 -version

fastq-dump.2.1.7 : 2.1.7

mkosinski@mkosinski-E540:~$ ls  -l /usr/bin/fastq-dump.2.1.7 
-rwxr-xr-x 1 root root 93384 cze 15  2012 /usr/bin/fastq-dump.2.1.7

答案1

我收到了biostars的答复：https://www.biostars.org/p/162483/#162526 这是文件的问题.sra，而不是的问题SRA Toolkit。

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