在多核上运行 GNU Octave 脚本

在多核上运行 GNU Octave 脚本

我正在我的 4 核 PC 上使用 GNU Octave 4.0.0 计算蒙特卡洛模拟。模拟需要将近 4 个小时来计算脚本 50,000 次(具体到我的问题),这是一个大量的计算时间。我想知道是否有一种方法可以在多个内核上同时运行 Octave 以减少计算时间。

提前致谢。

答案1

GNU Parallel 不会执行多线程,但它将要进行多处理,这对你来说可能就足够了:

seq 50000 | parallel my_MC_sim --iteration {}

默认情况下,每个 CPU 核心有 1 个进程,并确保两个并行作业的输出不会混合。

您甚至可以将这种并行化放入 Octave 脚本中。看https://www.gnu.org/software/parallel/parallel_tutorial.html#Shebang

GNU Parallel 是一个通用并行器,可以轻松地在同一台计算机或多台您可以通过 ssh 访问的计算机上并行运行作业。它通常可以代替for循环。

如果您想要在 4 个 CPU 上运行 32 个不同的作业,则并行化的直接方法是在每个 CPU 上运行 8 个作业:

简单的调度

相反,GNU Parallel 在完成后会生成一个新进程 - 保持 CPU 处于活动状态,从而节省时间:

GNU 并行调度

安装

如果您的发行版未打包 GNU Parallel,您可以进行个人安装,不需要 root 访问权限。这样做可以在 10 秒内完成:

(wget -O - pi.dk/3 || curl pi.dk/3/ || fetch -o - http://pi.dk/3) | bash

对于其他安装选项,请参阅http://git.savannah.gnu.org/cgit/parallel.git/tree/README

了解更多

查看更多示例:http://www.gnu.org/software/parallel/man.html

观看介绍视频:https://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1

浏览本教程:http://www.gnu.org/software/parallel/parallel_tutorial.html

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