![在 Anaconda 中安装 RStudio 时出错:`/opt/anaconda3/lib/R/bin/exec/R: 加载共享库时出错:libreadline.so.6:](https://linux22.com/image/940454/%E5%9C%A8%20Anaconda%20%E4%B8%AD%E5%AE%89%E8%A3%85%20RStudio%20%E6%97%B6%E5%87%BA%E9%94%99%EF%BC%9A%60%2Fopt%2Fanaconda3%2Flib%2FR%2Fbin%2Fexec%2FR%3A%20%E5%8A%A0%E8%BD%BD%E5%85%B1%E4%BA%AB%E5%BA%93%E6%97%B6%E5%87%BA%E9%94%99%EF%BC%9Alibreadline.so.6%EF%BC%9A.png)
我目前正在尝试安装 Anacondas RStudio 版本。我已经从官方CRAN 存储库通过 apt 包管理器和最新版本的 RStudio。我当前版本的 R 安装在 中/usr/lib/R
,路径变量设置在 中/usr/bin/R
。运行 Anaconda Navigator 的 RStudio 安装程序时,它会尝试在 中安装单独版本的 R。/opt/anaconda3/lib/R
安装过程挂起,现在我无法在终端中输入 R 并打开“旧”R 版本。相反,我收到以下错误消息:
$ R
/opt/anaconda3/lib/R/bin/exec/R: error while loading shared libraries: libreadline.so.6: cannot open shared object file: No such file or directory
我尝试更新“旧” R 的路径变量,但由于在路径列表中/opt/anaconda3/bin
先于它,usr/bin
我仍然收到相同的错误:
$ export PATH=$PATH:/usr/bin/R
$ echo $PATH
/opt/anaconda3/bin:/opt/anaconda3/condabin:/home/username/.local/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/snap/bin:/opt/mplusdemo:/usr/bin/R
首先,我不确定这个错误是什么意思。这是什么libreadline.so.6
?我该如何解决这个问题?
其次,我是否需要并且建议通过 Anaconda 安装 R?我当前的版本是从 CRAN 存储库更新的,这意味着当更新可用时我会获得更新。相反,Anacondas 版本有多新?或者,创建指向 目录的符号链接是否usr/bin/R
明智/opt/anaconda3/bin
?
答案1
libreadline.so.6
任何官方的 deb 包都没有提供这个库Ubuntu 存储库,只有 Debian Jessie 有为它打包。如果您想保存 Anaconda - 使用以下命令手动安装此库
cd ~/Downloads
wget -c wget http://ftp.debian.org/debian/pool/main/r/readline6/libreadline6_6.3-8+b3_amd64.deb
wget -c http://ftp.debian.org/debian/pool/main/g/glibc/multiarch-support_2.19-18+deb8u10_amd64.deb
sudo apt install ./libreadline6_6.3-8+b3_amd64.deb ./multiarch-support_2.19-18+deb8u10_amd64.deb
然后重试从 Anaconda 启动 R。
更新如下。
1. 修复库问题
安装libreadline.so.6
删除了 OP 的错误信息,但导致了第二个错误:
$ /opt/anaconda3/lib/R/bin/R
/opt/anaconda3/lib/R/bin/exec/R: error while loading shared libraries: libncurses.so.5: cannot open shared object file: No such file or directory
此错误已由安装缺少的库:
sudo add-apt-repository universe
sudo apt-get install libncurses5
这删除了错误消息,现在可以从终端运行 Anaconda 的 R 版本。
$ /opt/anaconda3/lib/R/bin/R R version 3.2.2 (2015-08-14) -- "Fire Safety"
但它并没有解决 RStudio 安装挂起的问题。这似乎与没有先创建 R 环境。 下列的本教程至此,RStudio的安装就完成了。
2. 从 Anaconda Navigator 运行最新版本的 R 和 RStudio
安装后,很明显 Anaconda 的 R 和 RStudio 版本都相当过时。我发现最好从其官方存储库下载并更新:
cd ~/Downloads
wget -c https://download1.rstudio.org/desktop/bionic/amd64/rstudio-1.4.1717-amd64.deb
sudo apt-get install ./rstudio-1.4.1717-amd64.deb
重新创建 CRAN 版本的 R 的路径只需/opt/anaconda3/bin/R
从路径中删除符号链接即可。
sudo rm /opt/anaconda3/bin/R
至于在 Anaconda 中运行最新版本的 RStudio(已经预先安装),只需从 Anaconda 的 RStudio 目录中删除现有的符号链接,然后创建一个指向“旧”安装目录的新符号链接即可:
sudo rm /opt/anaconda3/envs/renv/bin/rstudio
ln -s /usr/lib/rstudio/bin/rstudio /opt/anaconda3/envs/renv/bin/rstudio
这最后一步可以从 Anaconda 运行最新版本的 R 和 RStudio。