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在 Ubuntu 13.10（或更新版本）上编译旧版本的 R（2.11 或更早版本）？

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在 Ubuntu 13.10（或更新版本）上编译旧版本的 R（2.11 或更早版本）？

我正在尝试编译旧版本的 R（具体来说是 2.11.1）。你可能会问“为什么？”好吧，我有一个程序正在尝试运行（不是我写的，但我希望在我的研究中使用），它是用“旧”R 编写的，程序编写者特别提到 R-2.11.1 或更早版本必须使用。

  • 我运行./configure后没有出现明显的错误（整个输出太长，无法在这里发布，但我被警告说我无法制作 PDF、DVI 或 HTML 版本的帮助页面，但我对此并不太担心）。

  • 接下来，当我传递make命令时，遇到了以下错误（在一长串成功的命令之后）：

    Warning in solve.default(rgb):
unable to load shared library '/home/sbowerma/Programs/R-2.11.1/modules//lapack.so':
/home/sbowerma/Programs/R-2.11.1/lib/libRlapack.so: undefined symbol: _gfortran_compare_string
Error in solve.default(rgb) : lapack routines cannot be loaded
Error: unable to load R code in package 'grDevices'
Execution halted

然而，我已经确认图书馆lapack.so确实位于它应该所在的准确位置。

答案1

构建R-2.11.1过程似乎默认编译其自己的 BLAS 和 LAPACK 库版本（asR-2.11.1/lib/libRblas.so和R-2.11.1/lib/libRlapack.so）——即使这些库的系统版本可用。由于我无法确定的原因，这些本地构建的库似乎无法正确链接gfortran运行时库（至少在 64 位 Ubuntu 13.10 上不是）。

使用./configure --help你会看到

Optional Packages:
  --with-PACKAGE[=ARG]    use PACKAGE [ARG=yes]
  --without-PACKAGE       do not use PACKAGE (same as --with-PACKAGE=no)
  --with-blas             use system BLAS library (if available), or specify
                          it [no]
  --with-lapack           use system LAPACK library (if available), or specify
                          it [no]

因此，解决方法是确保系统上安装了适当的 BLAS/LAPACK（或 ATLAS）开发包，然后将--with-blas和--with-lapack选项添加到配置中，例如

./configure --with-blas --with-lapack --prefix=/usr/local

配置报告现在应该显示类似

External libraries:      readline,BLAS(generic),LAPACK(generic)

然后你就应该能够完成make。

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