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如何根据数字在列中连续出现的次数来选择行？

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如何根据数字在列中连续出现的次数来选择行？

我有一个如下所示的文件：

chr1    3000823 3000829 1  
chr1    3001003 3001009 1  
chr1    3001014 3001020 1  
chr1    3001273 3001279 2  
chr1    3001625 3001631 3  
chr1    3003222 3003228 4  
chr1    3003335 3003341 4  
chr1    3003375 3003381 4  
chr1    3003578 3003584 4  
chr1    3003636 3003642 4  
chr1    3003717 3003723 4  
chr1    3003881 3003887 4  
chr1    3003894 3003900 4  
chr1    3004526 3004532 5  
chr1    3005994 3006000 6  
chr1    3006183 3006189 6  
chr1    3006412 3006418 7  
chr1    3006778 3006784 8  
chr1    3006877 3006883 8  
chr1    3007166 3007172 9  
chr1    3007426 3007432 10      
chr1    3007528 3007534 10  
chr1    3007576 3007582 10

我只想获取第四列中包含特定次数任意数字的行。

假设我想在第 4 列中获取具有 3 倍相同数字的行，因此输出将是：

chr1    3000823 3000829 1  
chr1    3001003 3001009 1  
chr1    3001014 3001020 1  
chr1    3007426 3007432 10  
chr1    3007528 3007534 10  
chr1    3007576 3007582 10

..这是因为这些行的数字 1 和 10 在第 4 列中出现了 3 次

任何想法将不胜感激。谢谢！

答案1

解决方案awk：

awk 'FNR==NR{c[$4]++;next;} c[$4]==3' file.dat file.dat

输出：

chr1    3000823 3000829 1  
chr1    3001003 3001009 1  
chr1    3001014 3001020 1  
chr1    3007426 3007432 10      
chr1    3007528 3007534 10  
chr1    3007576 3007582 10

解释：

  • FNR==NR：当记录数等于文件中的记录数时，此测试为真。这仅适用于第一个文件，因为第二个文件NR将等于 file1 + FNR 的行数。
  • c[$4]++：将数组元素索引增加$4。我用它作为计数器。
  • next：跳到下一条记录，不做任何其他事情。
  • c[$4]==3：这只发生在第二个文件的记录上。如果此测试成功，则将打印该行，因为打印是awk.

这段代码的缺点是要读取文件两次，但在我看来，这是完成这项工作的一种干净且易于理解的方法。

答案2

{
  i = int(count[$4])
  arr[$4,i] = $0
  count[$4]++
} 

END {
  for (i in count) {
    if (count[i]== n) {
      for (j=0; j<n; j++) {
        printf("%s\n", arr[i,j])
      } 
    } 
  }
}

sample run --

awk -v n=3 -f 1.awk 1.dat 
chr1 3007426 3007432 10
chr1 3007528 3007534 10
chr1 3007576 3007582 10 
chr1 3000823 3000829 1
chr1 3001003 3001009 1
chr1 3001014 3001020 1

awk -v n=8 -f 1.awk 1.dat 
chr1 3003222 3003228 4
chr1 3003335 3003341 4
chr1 3003375 3003381 4
chr1 3003578 3003584 4
chr1 3003636 3003642 4
chr1 3003717 3003723 4
chr1 3003881 3003887 4

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