根据我读到的说明,运行make
可以解决 FunSeq2 的 TFMpvalue 安装问题,但是当我这样做时出现此错误:
root@milad:/home/milad/funseq2-1.0# cd '/home/milad/funseq2-1.0/TFM-Pvalue'
root@milad:/home/milad/funseq2-1.0/TFM-Pvalue# make
g++ -O3 -DJASPAR=1 -DPROGRAM=0 TFMpvalue.cpp Matrix.cpp ArgumentException.cpp FileException.cpp ParseException.cpp -o TFMpvalue-pv2sc
TFMpvalue.cpp: In function ‘void arguments(int, char* const*)’:
TFMpvalue.cpp:503:45: error: ‘getopt’ was not declared in this scope
while (((option = getopt(argc,argv,options)) != EOF)) {
^
TFMpvalue.cpp:507:23: error: ‘optind’ was not declared in this scope
OPTIONS[option] = optind-1;
^
make: *** [TFMpvalue-pv2sc] Error 1
这是什么问题?我该如何解决?
答案1
问题是TFMpvalue.cpp出了问题:
sudo chown username:username TFMpvalue.cpp
- 取消注释TFMpvalue.cpp中的第16行,并将GetOpt.h更改为getopt.h