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为什么“gedit”不能读取*.FASTA 文件？

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为什么“gedit”不能读取*.FASTA 文件？

我在 Linux 16.04 上分析了我的 *.fasta 文件。我想查看 *.fasta 文件的内容。因此我运行了以下命令：

gedit SRR662431.fasta

读取内容的进度将开始，但过了一会儿，gedit 将被关闭，并且我在终端中看到以下消息：

(gedit:10466): Gtk-CRITICAL **: _gtk_text_line_char_locate: assertion 'char_offset >= 0' failed

(gedit:10466): Gtk-ERROR **: Char offset -2147483648 is off the end of the line
Trace/breakpoint trap (core dumped)

如果您能指导我解决这个问题我将不胜感激。

答案1

顺便说一句，这是一个生物信息学问题，因此最好放在合适的社区中，例如https://bioinformatics.stackexchange.com/。

然而，答案很可能很简单：你的尝试查看 6.2Gb 的文件，因此您的 gedit 可能会耗尽内存。如果您确实想要查看原始测序读取，您可能需要尝试 ，也许可以与和less结合使用。headtail

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